| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 493 (0.800) | 26 (0.050) | 9/94 | NT | 6.5% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 337 (0.650) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG < 1:42780097/68‑1TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG < 1:7574711/68‑1 acCCGCCGGGTGAGGGGAGAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCCGCGCTGCGATCCCGCC < 1:4884311/66‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:9543120/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:38753171/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:3607820/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:10050232/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:40521147/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:33549627/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:48794268/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:2185918/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:5848625/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG < 1:7065200/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:1202688/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:10783865/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:7319471/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:1680666/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAACCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCgg > 1:48151161/1‑66 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:10337677/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCTTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTa > 1:41771462/1‑67 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCACCGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:19101275/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:25244309/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:8259567/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:43061085/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:32323675/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:31687478/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:30274200/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:30197994/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:39464162/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |