| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 222376 = | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/98 | NT | NA | noncoding (131/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | CP009273 | 222394 = | NA (NA) | noncoding (149/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 1473 total aligned reads displayed.
TTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/222449‑222376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGGA > CP009273/222394‑222461 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:38977346/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:20956101/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:4123015/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:17598408/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:16265376/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:14447151/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:31743615/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:25385763/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:37887066/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:3458473/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:4638452/1‑68 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCTTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:47917263/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGACACA < 1:49723279/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:24600908/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:3497394/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:23421648/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:44453647/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:39706072/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:12685744/68‑1 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:19863452/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:45319781/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:32505908/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:6998952/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:24173731/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:1573005/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:30380705/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:17336656/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:22545051/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:18042773/1‑68 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1:50240701/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:4014181/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:4997703/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:433238/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:47424860/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:29518548/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:2724264/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:2799753/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:25733211/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:25106885/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:13305276/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:11870027/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:22159840/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:29032366/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:30817693/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:31441824/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:2129934/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:32894166/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:10073499/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:18859012/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:33684915/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:16844571/66‑1 GTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:10537239/68‑1 GTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:44886025/68‑1 ACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTAC > 1:32069989/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCC < 1:26935032/68‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:15099470/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:43882706/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:11095466/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:49136270/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:48795079/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:41729573/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:7819670/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:35607263/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:45939446/1‑67 CACACTATCATTAAATGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGAACC > 1:51331142/1‑67 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:42232976/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:26308744/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGAAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:13868201/1‑68 ACTATCATTAACTTAATCCATATGTTAATGAGGCGAACCGGGGTAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:2388017/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTATTGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:37414160/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:26584952/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:49439395/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:48338378/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:42748997/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:28523483/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:40674720/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:36649348/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:5964606/1‑64 TTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/222449‑222376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGGA > CP009273/222394‑222461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |