| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 442683 | 521 (0.840) | 57 (0.110) | 13/90 | NT | 9.6% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
| ? | CP009273 | = 442722 | 656 (1.320) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:25887974/68‑1TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:7253915/68‑1TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:33267549/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:40841245/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:42408635/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:25469711/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:32937813/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:29160798/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:15041669/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:40026731/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:15280621/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:40285840/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:30691279/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:43684236/1‑65 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:46539198/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:22498614/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:858435/1‑67 GGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGC < 1:1794874/67‑1 AAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGC < 1:28232525/67‑1 AAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGC < 1:20819434/67‑1 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:19091087/67‑1 AATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC > 1:6503070/1‑66 GGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGT > 1:45854121/1‑68 GCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGT > 1:564501/1‑68 GCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGGGCGGTAACCGGT > 1:3779847/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:24847319/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:30057720/1‑68 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTTCTGTGCGGTAACCGGTGAGT > 1:16936657/1‑67 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGGTCGGCTACTGTGGGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:10176473/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:39202285/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:34154687/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTTACCGGTGAGTTCG > 1:4330656/1‑68 AGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGC > 1:220644/1‑68 AGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGC > 1:47376136/1‑68 AGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGC > 1:6945951/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:33972591/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:1177669/1‑68 ATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTGACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:13344868/1‑67 ATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:41829340/1‑67 GCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGC > 1:1122176/1‑68 GCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTAACCGGTGCGTTCGATAGCGGCGC > 1:32480120/1‑68 GGATCGCTGCGCCGCCGGTGGTCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGAT > 1:19638393/1‑67 GGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGAT > 1:4833862/1‑67 cgcCGCTGCGCCGCCTGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCTGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCC < 1:43035461/65‑1 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTG < 1:33443059/67‑1 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:7814899/1‑66 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGCTCCT > 1:36576743/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCT < 1:48467412/68‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCT < 1:29752454/68‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:5575543/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:48819476/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:40564125/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:48112135/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:37063229/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:10369790/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:35444138/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:35137945/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:16243261/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:17293768/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:31480471/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:20619931/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:23599519/1‑65 tcCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:426962/66‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:10973959/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:1514829/68‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:20411305/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:36103782/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:36628493/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGCAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGG < 1:34491922/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:27362000/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:42017978/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:31096150/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:40353025/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:50304922/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:31265898/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:49153191/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:32105189/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:19377242/68‑1 GCGCCGCCGGTAATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:27622097/68‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGCTAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:9505579/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:8715918/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:1151525/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA < 1:12197650/68‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:1282485/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:49941269/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:13939424/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |