| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2279605 = | 535 (0.860) | 21 (0.040) | 8/86 | NT | 5.6% | coding (1751/1761 nt) | yejM | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor |
| ? | CP009273 | 2279638 = | 292 (0.610) | intergenic (+23/‑52) | yejM/proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2279683‑2279605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatcagttagcgaAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA > CP009273/2279638‑2279703 GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTA < 1:27045173/67‑1 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:2363607/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:19913982/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:29228989/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:36493622/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:12139796/1‑67 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAAT < 1:42453821/67‑1 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAAT < 1:32625614/67‑1 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAAT < 1:26851451/67‑1 tacTACTACCGTTTTCCCCACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:31504950/64‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:18834961/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:40882267/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:27720695/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:37099859/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:48353504/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:3454965/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:666522/67‑1 TAATACTACCGTTATCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:30976983/67‑1 ATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTA > 1:15086766/1‑67 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC < 1:14211576/68‑1 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC < 1:40681629/68‑1 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC < 1:24875993/68‑1 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC < 1:51045230/68‑1 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC < 1:24308626/68‑1 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC > 1:5976888/1‑68 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGC > 1:23176027/1‑68 TACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGAAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCATTTAGC < 1:49651329/68‑1 ACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCG > 1:34733414/1‑68 ACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCG < 1:939628/68‑1 ACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCG > 1:45145613/1‑68 ACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCG > 1:50612267/1‑68 CTACCGTTTTGCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:50579492/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA < 1:21403429/68‑1 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:10056756/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:9107206/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:1055722/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:10991948/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:11267772/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:49182466/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:47515627/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:46954350/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:44850128/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:13509501/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:35218306/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:15348380/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:16647492/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:1688725/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:21793117/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:20953051/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:24475852/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:25021540/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:18126037/1‑68 CTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA > 1:2612375/1‑68 TGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGG < 1:17492293/68‑1 TGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGG < 1:41499135/68‑1 TGCAAGTAAGATATATCGCTAACTGATTAAAAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGG < 1:17128336/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGT < 1:20627234/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGT < 1:39365264/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGT < 1:47724303/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGT < 1:19142017/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGT < 1:15863619/68‑1 GCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGAAAAATCTTACTTGCAATCGGT < 1:11721187/68‑1 AATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGG < 1:12734431/68‑1 AATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCG > 1:27219554/1‑67 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGCGTCGGC > 1:19334300/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:30050972/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:49416771/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:10428392/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:44307970/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC < 1:6749801/68‑1 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:50879546/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:25419919/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:1301450/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:39956346/1‑68 ATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:37248642/1‑68 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:11046065/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:31287394/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:41922902/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:23954708/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:13279040/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:39601766/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:8862321/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:23452006/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:14155998/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:36156877/1‑67 TCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGC > 1:28479269/1‑67 CAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCAC < 1:7172556/68‑1 CAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCAC < 1:33136219/68‑1 AGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACG > 1:33335196/1‑68 AGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACG > 1:4729309/1‑68 TAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAG < 1:37727639/68‑1 TAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTA < 1:31731783/67‑1 TAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTA < 1:27499200/67‑1 AGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGC < 1:45437872/68‑1 AGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGC < 1:12456527/68‑1 GAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA < 1:46596677/68‑1 GAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA < 1:38691951/68‑1 GAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA < 1:8962798/68‑1 GAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA < 1:18992947/68‑1 GAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGGCGGCACGTAGCGCA < 1:43609101/68‑1 GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2279683‑2279605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatcagttagcgaAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA > CP009273/2279638‑2279703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |