| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2691481 | 624 (1.010) | 44 (0.080) | 16/100 | NT | 6.9% | coding (429/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound |
| ? | CP009273 | = 2691501 | 639 (1.160) | coding (409/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < CP009273/2691501‑2691436 TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACACCGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:21295140/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:7489696/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:46274784/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:12679024/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:22107961/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:17349287/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:4603114/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:9399126/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:28570963/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:33298432/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:35756706/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:49157696/1‑68 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCCTCGTCAATACCCCACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:22914344/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCCACCACCATAGCCCCGCTGAATTTG > 1:50086467/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCACCCCCCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:120747/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:19433865/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:40172321/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:45276851/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:46803923/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:44637192/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:43126507/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1454371/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:33379675/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:10307684/1‑66 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:42335504/1‑67 CATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGGCGCGGGTT > 1:13685580/1‑68 CATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCGGCCGCGGGgg > 1:16522604/1‑66 ACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATC > 1:39234126/1‑67 ACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCG > 1:25416301/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGGCAAATTAAGCGT > 1:6187521/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:18036986/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTGAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:7028872/1‑68 CCAACCACCATAGCCCCGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTTATCTTATCGCCAGCCAACTTCAGCGTG > 1:24197972/1‑68 ACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCT > 1:31309807/1‑68 ACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCT > 1:49085089/1‑68 CACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGGCAGGCAAATTAACCGGGGCTAT > 1:1900633/1‑68 ACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATG > 1:2688930/1‑68 ATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTG > 1:14757438/1‑68 AGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCCGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGT > 1:15039358/1‑68 AGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGg > 1:343876/1‑67 GCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTT > 1:33908515/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCTCCAGCCAAATTCAGGGTGGCTATGGTGGTTG > 1:32017232/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTTTGGTGGTTG > 1:32844570/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:36734872/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:37012115/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:14269862/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:23762951/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:31138506/1‑68 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:4068256/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:43018581/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:16575757/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:48576791/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:5956308/68‑1 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:47545587/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:13401526/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:14671453/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:41857143/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:1881494/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:20540734/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:27594786/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:48195385/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:3527920/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTGGGTATTGACGATGC > 1:48368420/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCTGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:37861306/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGCCGATGCG > 1:48500710/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:49341226/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:45327596/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:7980838/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:43722752/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:47665517/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:9886541/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:11492276/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:42071689/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:41635516/1‑68 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CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:20405946/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:27972454/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:29433078/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:34982583/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:35802769/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:39817053/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:42238652/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGGATTGACGATGCG > 1:49639752/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGGGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:25052619/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTAGGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:21970433/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATAGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTAGGGTGGTTGGGTATTGACGCTGCG > 1:29102866/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |