| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614731 = | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/98 | NT | 100% | coding (2180/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614737 = | 0 (0.000) | coding (2186/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 | ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:8488682‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:31781784‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:29760850‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:1419956‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:14220379‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:7959091‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:45339272‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:50078995‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:19488380‑M2/67‑68 (MQ=255) gcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtcagtca > 1:44984979‑M2/66‑68 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccccccggtgcccttcgctgatatggcggatgtctgTCa > 1:49621417‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:10172092‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:33066064‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:35664184‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:42274839‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:8313386‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:18953516‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:17067041‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:13233614‑M2/65‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtccg < 1:24265521‑M2/4‑3 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:25149889‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:35265608‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:28702737‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:540053‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:34650599‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:39228288‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:26395999‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:5349667‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:44106513‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:32611565‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGc < 1:20912927‑M2/5‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatttctgTCAGcc > 1:34247541‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:35622740‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:37384835‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:50118691‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:10880772‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:47657630‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:16336321‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:12689325‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:2778418‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:16103332‑M2/63‑68 (MQ=255) ttctcatcttagctgttatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCATCCa < 1:44877520‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggcttatgtctgTCAGCCa < 1:37801596‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:47616385‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:50743950‑M2/7‑1 (MQ=255) ctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCata < 1:18645859‑M2/9‑1 (MQ=255) catccctgaaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGc < 1:220423‑M2/14‑1 (MQ=255) tacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGa < 1:48303464‑M2/16‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggtgccctgcgctgatatggcggctggctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:40256924‑M2/21‑1 (MQ=255) tatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:29081227‑M2/16‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACTGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:22091335‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATTAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:24586173‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGccc > 1:13444041‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:50389201‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:7260416‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:5325409‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:16658523‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:9647472‑M2/68‑1 (MQ=255) 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TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:26753833‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:34772480‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTCCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:28823603‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATAAGCGAAGGGAACCGGGTGGCGGTGCATTACAGCTAAGATGAGAAAGGCCGGCTTAc > 1:28013057‑M2/1‑67 (MQ=255) | ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |