| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4610977 = | 632 (1.020) | 3 (0.010) | 3/96 | NT | 0.62% | coding (278/720 nt) | deoD | purine‑nucleoside phosphorylase |
| ? | CP009273 | 4611006 = | 417 (0.790) | coding (307/720 nt) | deoD | purine‑nucleoside phosphorylase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 633 total aligned reads displayed.
TTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATG > CP009273/4610939‑4611072 | tttCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGcgcg > 1:6690745/1‑68 (MQ=255)tttCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGcgcg > 1:42881468/1‑68 (MQ=255) tCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGGGGGTTCCTGTGTCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAc < 1:2902693/68‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgt < 1:8963834/68‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgt < 1:46313987/68‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgt < 1:26010915/68‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGAAAATTATCCGCGGGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgt < 1:37576384/68‑1 (MQ=255) gCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTTGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgtc > 1:33325622/1‑68 (MQ=255) cGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGAcgtc < 1:10189941/67‑1 (MQ=255) gaagaaAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGtt < 1:32859501/67‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:26628590/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:12281867/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:26996987/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:24666027/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:34412781/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:23365570/66‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:21914786/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:23109851/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:17079900/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:16709081/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:36191455/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:14637169/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:8665244/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:9176402/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGGCGTTATCGGt < 1:10500817/68‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGT‑AAACTGCGCGACGTCGTTATCGGt < 1:22125448/67‑1 (MQ=255) aaaTTATCCGCGTGGGTGCCTGGGGCTCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCg < 1:43416816/66‑1 (MQ=255) aTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTAt > 1:4081627/1‑68 (MQ=255) aTTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTAt > 1:31693225/1‑68 (MQ=255) aTCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATggg > 1:13552633/1‑68 (MQ=255) aTCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATggg > 1:2558626/1‑68 (MQ=255) aTCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATggg > 1:38654916/1‑68 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGt > 1:46633530/1‑67 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:18990308/68‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:30390444/68‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:20056765/68‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:39224704/68‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:10833434/68‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGGTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg < 1:45873279/68‑1 (MQ=255) cgcgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg > 1:38304275/1‑67 (MQ=255) cgcgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTg > 1:46121053/1‑67 (MQ=255) gcgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGcc < 1:5082509/68‑1 (MQ=255) gggTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGc < 1:239285/67‑1 (MQ=255) gggTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGc < 1:44694003/67‑1 (MQ=255) ggTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCa > 1:2767196/1‑67 (MQ=255) ttCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCg > 1:1330324/1‑68 (MQ=255) ttCCTGTGGCGCAGTACTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCg > 1:39770584/1‑68 (MQ=255) tCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGa > 1:23756730/1‑68 (MQ=255) tCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGa > 1:50593528/1‑68 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAACACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAt < 1:15023679/68‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAt > 1:22848687/1‑68 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAt < 1:47779352/68‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAt < 1:25435081/68‑1 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAt < 1:8042191/68‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAtt < 1:41273794/68‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAtt < 1:18105231/68‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGAtt < 1:37265381/68‑1 (MQ=255) tgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCa > 1:28284785/1‑68 (MQ=255) ggCGCAGTTCTGCCGCACGTAACACTGCGCGACGGCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCaa < 1:3649321/68‑1 (MQ=255) CGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCaaa > 1:5241959‑M1/1‑67 (MQ=255) GCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAg > 1:3402579‑M1/1‑67 (MQ=255) GCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAg > 1:25085371‑M1/1‑67 (MQ=255) GCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGt > 1:20497075‑M1/1‑68 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATTCGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCag > 1:11707260/1‑66 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAt > 1:1260322/1‑67 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAt > 1:45043218/1‑67 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAt > 1:949327/1‑67 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAt > 1:41783637/1‑67 (MQ=255) cGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAt > 1:13816352/1‑67 (MQ=255) tggTAAAACTGCGCTACTTCGTTATCTGTATGGGTGCCTTCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:18812050/66‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:48569962/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:21254817/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:29899212/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:31403800/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt > 1:47373714/1‑68 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:13121999/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:37976170/68‑1 (MQ=255) aCGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGt < 1:35230230/68‑1 (MQ=255) aactgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGGTAACCGCATCCGTTTTaaa > 1:16208830‑M2/9‑68 (MQ=255) actgcgcTACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:19401630‑M2/8‑68 (MQ=255) actgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:40113924‑M2/8‑68 (MQ=255) actgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:42401149‑M2/8‑68 (MQ=255) actgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:1607284‑M2/8‑68 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAACGa < 1:49837650‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:4719842‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:11062705‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:29351151‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:5559668‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:6461141‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAg > 1:28754223‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGa < 1:23617666‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGa < 1:49382398‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGa < 1:7382735‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGa < 1:17320471‑M2/62‑1 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCAACCGTTTTAAAg > 1:50130700‑M2/7‑67 (MQ=255) ctgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGAACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCAGTTTTAAAg > 1:32348954‑M2/7‑67 (MQ=255) tgcgcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGAc < 1:45415048‑M2/63‑1 (MQ=255) gcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCAt > 1:31102550‑M2/3‑68 (MQ=255) gcGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCAt > 1:14103248‑M2/3‑68 (MQ=255) gACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATg < 1:44064034/67‑1 (MQ=255) | TTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATG > CP009273/4610939‑4611072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |