| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1070400 | NA (NA) | 9 (0.020) | 7/98 | NT | NA | coding (3939/3963 nt) | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | CP009273 | = 1070404 | NA (NA) | coding (3935/3963 nt) | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 784 total aligned reads displayed.
AGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGATATTGCT > CP009273/1070337‑1070471 | gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTAGCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:32483395‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTGATTAAGCTGGCGTTACc < 1:47499057‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:10281240‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:40175246‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:45821944‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:46666654‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:29504212‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:12508663‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:12058564‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAACCTGGCGTTACc < 1:13235200‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGACATTAAGCTGGCGTTACc < 1:30014373‑M2/68‑2 (MQ=255) GGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGc < 1:6471994‑M1/68‑1 (MQ=255) GGAGGTTGTAACATCCTCCGGATACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGc < 1:23250917‑M1/68‑1 (MQ=255) GAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCa < 1:40568495‑M1/68‑1 (MQ=255) gTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCcagcggcagcg > 1:4840658/1‑68 (MQ=255) ttGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCcagcggcagc < 1:25554216/66‑1 (MQ=255) tGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACcgccagcttaatgact > 1:22659986‑M2/1‑52 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:39781322/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:17342694/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:33609082/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:43141459/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:45234915/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:48182729/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:29087101/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:5381548/68‑1 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:36560019/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:8426896/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:9445537/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:21613020/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:15149355/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:1671062/1‑68 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:39049978/1‑67 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:37222842/1‑67 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:31289502/1‑67 (MQ=255) aTCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:14808020/1‑68 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:34365388‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:16064081‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:27329064‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:50849071‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:47022146‑M2/9‑66 (MQ=255) ctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCacac > 1:44628550‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGc < 1:15557615‑M2/65‑1 (MQ=255) gcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCg > 1:10037896‑M2/3‑68 (MQ=255) gcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCg > 1:7609707‑M2/3‑68 (MQ=255) ccTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAAc > 1:2661407/1‑67 (MQ=255) ccTGTTTAACATATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACg < 1:6697064/68‑1 (MQ=255) cTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGc < 1:38806435/68‑1 (MQ=255) cTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTAACcgccagcttaatgactataggttaaacaggtagcc > 1:36145433‑M2/1‑33 (MQ=255) tGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGc > 1:41424950/1‑67 (MQ=255) tGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGc > 1:38472332/1‑67 (MQ=255) gTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTc > 1:17058679/1‑68 (MQ=255) gTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTc < 1:35119230/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGTCATCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:35748339/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGTAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:30527123/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:46262749/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:11236133/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:20767516/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:18702695/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:32741457/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:28030783/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGGCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:8907147/68‑1 (MQ=255) aaCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGata < 1:24971454/68‑1 (MQ=255) aaCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGata < 1:21012186/68‑1 (MQ=255) aCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGatat > 1:33033613/1‑68 (MQ=255) aCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGatat > 1:19171548/1‑68 (MQ=255) aCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACCCTCGatat > 1:10831791/1‑68 (MQ=255) ccTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGatat > 1:49194453/1‑67 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:14573940/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:44081916/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:42756956/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:42373429/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:41738145/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:4092678/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:28396034/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:27668739/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATACACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:49963583/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGAGGCAGCGGAATTCACACTCAGCGAACGCTCGAtata > 1:7086559/1‑67 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:25933189/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:37008022/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:14058641/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAAAGcc > 1:23860750/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:28641142/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:10517515/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:37567542/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:18433824/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:6066217/1‑68 (MQ=255) tCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGt > 1:19698946/1‑68 (MQ=255) cATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg < 1:13587857/66‑1 (MQ=255) 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cGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGata > 1:24508103/1‑68 (MQ=255) gTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGatat > 1:24110444/1‑68 (MQ=255) | AGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGATATTGCT > CP009273/1070337‑1070471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |