| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1586885 = | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/90 | NT | NA | intergenic (‑186/+37) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
| ? | CP009273 | 1586916 = | NA (NA) | intergenic (‑217/+6) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog | |||||
Only 100 of 747 total aligned reads displayed.
ATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTT > CP009273/1586849‑1586983 | aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:2579482/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:8630667/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:22138486/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:26228966/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:38408530/1‑68 (MQ=255) aGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACg < 1:41490608/68‑1 (MQ=255) gCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt > 1:4617057/1‑68 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:16609603/67‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:10009825/67‑1 (MQ=255) gTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGttt > 1:39022965/1‑68 (MQ=255) ttGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGGCATCTCGACATGCGGCTTATTCGGttt > 1:42962520/1‑67 (MQ=255) tGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTa < 1:15434617/67‑1 (MQ=255) gATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTAcc > 1:43589498/1‑68 (MQ=255) agtgaaatatagctggtaaaccgtaTAAGCCGCATGCCATGTCGCCATGCGGCTTATACGGTTTACCa < 1:10636016‑M1/43‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCa > 1:34450781/1‑68 (MQ=255) tGCGCCGTTTGATGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCa < 1:35659440/67‑1 (MQ=255) tGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATTCGGCTTATACGGATTACCa < 1:28310642/67‑1 (MQ=255) tGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAg < 1:36163131/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:28690676/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:14870957/68‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCta > 1:30776524/1‑68 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:49001694/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:5676205/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:43903926/67‑1 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCTCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtat < 1:45478875/67‑1 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtata > 1:33650669/1‑68 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtata < 1:2776043/68‑1 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtat < 1:21490387/67‑1 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtat < 1:43187357/67‑1 (MQ=255) gtatGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTatat < 1:25205751/65‑1 (MQ=255) gTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTatat < 1:31586520/68‑1 (MQ=255) aGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCAc < 1:50561374/67‑1 (MQ=255) aGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACt < 1:32077957/68‑1 (MQ=255) gTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACt > 1:45221532/1‑67 (MQ=255) cGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTcc < 1:29155964/67‑1 (MQ=255) cGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATAATTCACTccc < 1:7696577/68‑1 (MQ=255) cAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAg < 1:44524481/67‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:4790185/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:9478393/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:36811007/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:6065310/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:46666368/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:6490166/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:45680639/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:29860202/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:29483138/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:824193/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:2658220/68‑1 (MQ=255) ataagccgcatgtcgagatggcatgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:8952168‑M2/35‑1 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGCCATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:2438781‑M1/66‑1 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:40630133‑M1/66‑1 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCGATATTTCACTCCCCGCATGc < 1:22693975‑M1/66‑1 (MQ=255) AGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTg > 1:19387804‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:18730314‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:49435853‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:16992943‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:47523682‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:13624793‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:26932366‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:27248717‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:34086673‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:7317037‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACAGGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:33039710‑M1/68‑1 (MQ=255) CCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAg < 1:49758171‑M1/68‑1 (MQ=255) CCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAg < 1:45916985‑M1/68‑1 (MQ=255) ctCATGCCATCTCGACATTCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCAAGCCCTGa > 1:19722519‑M1/3‑66 (MQ=255) CGCATGCGATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 1:18135114‑M1/1‑68 (MQ=255) CGCATGCCATCTCTACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 1:24577382‑M1/1‑68 (MQ=255) CGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa > 1:48664021‑M1/1‑66 (MQ=255) CGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa > 1:50821157‑M1/1‑66 (MQ=255) CGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 1:10971753‑M1/1‑68 (MQ=255) CGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 1:5007327‑M1/1‑68 (MQ=255) CGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt < 1:32519363‑M1/68‑1 (MQ=255) GCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTa > 1:30097787‑M1/1‑68 (MQ=255) TGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCg > 1:23468723‑M1/1‑68 (MQ=255) TGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCg > 1:17328408‑M1/1‑68 (MQ=255) gtcgagatggcatgcgccttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc < 1:16001692‑M2/47‑1 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATc < 1:12821445‑M1/66‑1 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:3967082‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:20418591‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:13418725‑M1/1‑68 (MQ=255) ccATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt > 1:14158880/1‑68 (MQ=255) ccATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt > 1:21702202/1‑68 (MQ=255) cATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:42172655/67‑1 (MQ=255) gACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt < 1:47051237/68‑1 (MQ=255) gACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt < 1:17866957/68‑1 (MQ=255) gACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt < 1:40074807/68‑1 (MQ=255) aCATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCtt > 1:38147704/1‑68 (MQ=255) aCATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCtt > 1:6691366/1‑68 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:11417532‑M2/12‑68 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:42562148‑M2/12‑68 (MQ=255) tgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTa > 1:20189825‑M2/10‑67 (MQ=255) ggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCAc < 1:35052863‑M2/62‑1 (MQ=255) cttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCAcc < 1:12143558‑M2/63‑1 (MQ=255) ttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTa < 1:23968756‑M2/65‑1 (MQ=255) ttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTa < 1:23794122‑M2/65‑1 (MQ=255) ttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTa < 1:21026445‑M2/65‑1 (MQ=255) ttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTa < 1:37189071‑M2/65‑1 (MQ=255) aTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGt < 1:36543321‑M2/67‑1 (MQ=255) aTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGt < 1:37803528‑M2/67‑1 (MQ=255) | ATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTT > CP009273/1586849‑1586983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |