| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 930,950 | A→C | 8.0% | Q757H (CAA→CAC) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 930,950 | 0 | A | C | 8.0% | 1466.1 / 17.4 | 609 | Q757H (CAA→CAC) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (209/305); new base C (46/6); total (294/315) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.50e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 630 total aligned reads displayed.
TTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAG > CP009273/930883‑931016 | gAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGt < 1:50895289/68‑1 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCACTATCACCAGCCGCAACACCCGGtg > 1:17035073/1‑66 (MQ=17) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGtt > 1:39226469/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGtt > 1:9493141/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATAAGCAGCCCCAACAACCAGta > 1:13486932/1‑66 (MQ=18) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCCGCCGCAACCACCAGTTcc > 1:31525954/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCTCACCAAGCTGTTcc > 1:42245979/1‑68 (MQ=17) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGttgc > 1:47125811/1‑66 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:34012251/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:46719094/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:32675403/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:24652615/1‑68 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTcc > 1:5670605/1‑67 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTccg < 1:3477578/68‑1 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTgcg < 1:4116088/68‑1 (MQ=11) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACCACCCGTTCcgccgc > 1:10274374/1‑68 (MQ=11) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGcgccgc > 1:4770455/1‑68 (MQ=11) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCcgccgc > 1:21388277/1‑68 (MQ=14) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCACTATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTgcgccg > 1:38025097/1‑67 (MQ=11) 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agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:14098856/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:12664274/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:3582740/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:36347197/66‑1 (MQ=255) cGCATCAACCAGTTCCGCCGGAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:8765614/67‑1 (MQ=255) cGCAACTCCCTGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCAGAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:32291870/68‑1 (MQ=18) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:39545509/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:4566333/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:50591100/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:21921682/65‑1 (MQ=255) 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aacaacCAGATCCGACGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 1:21572130/68‑1 (MQ=255) | TTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAG > CP009273/930883‑931016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |