| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 930,957 | C→G | 6.1% | P760A (CCG→GCG) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 930,957 | 0 | C | G | 6.1% | 1738.7 / 22.0 | 562 | P760A (CCG→GCG) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (201/322); new base G (36/2); total (237/325) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 610 total aligned reads displayed.
ACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930890‑931024 | ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACATCCAGTTcc > 1:20482010/1‑68 (MQ=17) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCCGCCGCAACCACCAGTTcc > 1:31525954/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTcc > 1:10368333/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:46719094/1‑68 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTgcg < 1:4116088/68‑1 (MQ=11) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGcgccgc > 1:4770455/1‑68 (MQ=11) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCcgccgc > 1:36351684/1‑68 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCcgccgc > 1:38771809/1‑68 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCTGTTccgccg > 1:43859614/1‑67 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTgctccg > 1:21168874/1‑67 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:46347365/1‑68 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGCgccgca > 1:29428217/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:15571036/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:29985806/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcag > 1:37458791/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGCgccgcag > 1:2644456/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTGCgccgcag > 1:40667819/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:50640886/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:18668380/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:8433592/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcagcc > 1:11280192/1‑67 (MQ=17) agcCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgccgcc > 1:34118947/1‑67 (MQ=17) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACCACCAGTTCCgccgcagcc > 1:39258897/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACATCCAGTTGCgccgcagcc > 1:33080524/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcagcc > 1:25748216/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTGCgcctcagcc > 1:24386711/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:15037240/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:12370912/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCcccgcagc < 1:33508948/66‑1 (MQ=255) tgCAACCACCTGTTGCACAGCAGCATGATTATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:19164527/66‑1 (MQ=18) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCCGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:13355348/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:35868936/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:42169685/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:49534376/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:19543373/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:6795223/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:1630404/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccg < 1:36634738/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:48862029/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:40966047/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:40094682/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:23087466/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:45441253/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGATGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:901498/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:16675793/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:18259002/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:3266850/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:47103443/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:1930222/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACAGCAGGAGCATTATCAGCAGCAGCATCAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:27005470/68‑1 (MQ=18) aacaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTa > 1:14551249/1‑67 (MQ=255) aacaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTAt < 1:45661122/68‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATc < 1:5446663/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCGGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:15881658/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCTCAGCCGCAGTATcagct > 1:22333630/1‑66 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:9331973/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:42559658/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:10016310/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:21420185/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagca > 1:17341995/1‑67 (MQ=255) ggTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCagcagc < 1:22582657/68‑1 (MQ=255) gTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCCGCAGcc > 1:49790140/1‑68 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac > 1:14044842/1‑68 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:49313280/68‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:43254338/68‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:24535662/68‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:41821437/68‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:2767409/68‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCacaac < 1:11003077/68‑1 (MQ=255) gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAg > 1:6080440/1‑67 (MQ=255) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGt < 1:44548087/67‑1 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCCGTTGCGCcaca > 1:40419603/1‑67 (MQ=14) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCa > 1:3848519/1‑67 (MQ=255) gcagcagcaACAACCAGTACCGCCGAAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCTCaa > 1:17797464/1‑66 (MQ=14) gcagcCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAg > 1:21788783/1‑67 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc > 1:48505072/1‑68 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc > 1:7496913/1‑68 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc < 1:23273644/68‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCATTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:15264903/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:51079023/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:20062601/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:35005628/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:35442161/66‑1 (MQ=255) cGCATCAACCAGTTCCGCCGGAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:8765614/67‑1 (MQ=255) cGCAACTCCCTGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCAGAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:32291870/68‑1 (MQ=18) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:39605675/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:12636825/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:37996992/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:3071088/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:3188889/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:5701761/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:37036915/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:50219733/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat < 1:44799157/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat < 1:2924084/68‑1 (MQ=255) aacaacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 1:7085679/68‑1 (MQ=255) aacaacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 1:14245637/68‑1 (MQ=255) ccAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagca > 1:36132298/1‑68 (MQ=255) atcctccGCAGCAGCAGGATCAGCAGCCACACCAGCCGGTTGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCg < 1:2840839/67‑1 (MQ=21) ccgccgCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGca < 1:25089801/68‑1 (MQ=255) | ACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930890‑931024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |