| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2161385 | 406 (1.130) | 24 (0.080) | 11/90 | NT | 6.8% | intergenic (‑90/+85) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein |
| ? | CP009273 | = 2161396 | 333 (1.150) | intergenic (‑101/+74) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2161308‑2161385‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcacgatgccGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACCA < CP009273/2161396‑2161330 TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCTATAGAATCCTCCTTCATA < 1:15883846/68‑1 TTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGC < 1:11732231/68‑1 TTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGC < 1:27159925/68‑1 GCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGA > 1:20234074/1‑68 ATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT < 1:11031352/67‑1 ATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT < 1:23814366/67‑1 ATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT > 1:5908489/1‑67 TAAGCCCTATGTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:26323764/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTTACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:22156496/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:9280374/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:18240899/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:29598448/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:3633917/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:4220283/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:22584145/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:10944953/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:1170085/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:13352455/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:13006372/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:22977042/68‑1 AAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC < 1:18800776/68‑1 AAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC < 1:6187748/68‑1 AAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC < 1:15482620/68‑1 CCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATA > 1:25650134/1‑55 CTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGTTAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGGCGCTAAGTGg > 1:6564186/1‑67 CCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGCTGGCGATAAGTGAAAGGCATCG > 1:2245471/1‑68 ATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAGGGCATGGTGCTATGAA > 1:20620572/1‑68 ACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAG > 1:9184898/1‑68 ACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGAGAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAG > 1:19255238/1‑68 CCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGTAGGGGG > 1:7678878/1‑68 CCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCGATGATGGAGG > 1:14373088/1‑68 AGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGTTTCTATGGA > 1:17830421/1‑68 ATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATTAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGT > 1:24001403/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATATGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:16600050/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGGTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:5585306/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:2501734/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:8979075/1‑68 CCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGGGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCA > 1:20316618/1‑68 ATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGA > 1:21631169/1‑68 ATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGA > 1:26459822/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:15881419/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:4567656/1‑68 GCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:8248393/1‑67 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:2360243/1‑68 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:28897302/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTTTCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:14228584/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTTGTCAATGGAAGAC < 1:23344762/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:4989510/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:27336102/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:27517595/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:8515274/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:28716507/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:25749626/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:9651476/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:16580270/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:13583843/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:15733205/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:21965286/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:2183641/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:2152704/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:12776643/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:4790966/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:6877096/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:21498583/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAACGGAAGAC < 1:29533044/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGGCAATGGAAGAC < 1:799101/67‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:15148068/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:20557280/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:21689819/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:5743343/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:2602991/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:11807237/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:25423164/68‑1 GATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGT < 1:7721601/68‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGATGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:24956578/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA < 1:9559402/68‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:7051540/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT > 1:15647184/1‑67 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:4667593/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:17092490/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:11955577/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:10050955/67‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:12521786/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:16312003/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:6033200/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:5672565/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:20746704/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:20828236/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:26068536/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:26067362/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:24365482/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:24767298/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:25296049/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA > 1:6736764/1‑67 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA > 1:1708906/1‑67 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA > 1:3530367/1‑67 CGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACCA < 1:519992/68‑1 CGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACC < 1:5880764/67‑1 CGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACC < 1:14952045/67‑1 CGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACC < 1:10382816/67‑1 TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2161308‑2161385‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcacgatgccGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACCA < CP009273/2161396‑2161330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |