| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613137 | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/98 | NT | NA | coding (586/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613192 | NA (NA) | coding (641/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613064‑3613137‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcggTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC < CP009273/3613192‑3613127 TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCTGTTGCCGG > 1:25962294/1‑68TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG < 1:12520944/68‑1TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGGTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:25928976/1‑68 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA > 1:27018319/1‑68 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:23184637/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:23012244/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:15355253/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:28584493/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:24218765/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:23370651/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:5555300/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:6691328/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:19369647/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:11030343/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:7852091/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:9404836/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:19585042/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:10231089/68‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC > 1:20481008/1‑68 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC < 1:18698891/68‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:13724744/67‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGGGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:28063960/67‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:12192260/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:20521657/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:10038826/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:18760008/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:5271844/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:21851123/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:22020097/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:17587752/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:25133919/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13195536/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:26754413/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13847912/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGCGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:4079184/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCAGCAGGGGCCGTGGTTGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:4100341/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGGCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:25868445/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGACCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1309836/68‑1 ATCTGGCGACAAACAATCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:24869760/68‑1 ATCTGCCGACAAAGAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTTTGAGCGGGTGCCGTAAGCG < 1:28509360/68‑1 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AAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTT > 1:27934687/1‑67 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTCCCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:17194679/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTTCC > 1:3009829/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTTCC > 1:27099018/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCCTCCGCTTCC > 1:16576322/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCa > 1:11412203/1‑67 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:20894765/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:29601549/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:12329942/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:2887600/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:28672736/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:12465532/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:7547520/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:13252839/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:11926446/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:7275402/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:10947020/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:6202296/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:21866584/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:22634187/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:22635892/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:9166797/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |