| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3202855 = | NA (NA) | 7 (0.020) | 3/94 | NT | NA | intergenic (+9/+34) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein |
| ? | CP009273 | 3202881 = | NA (NA) | intergenic (+35/+8) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein | |||||
Only 100 of 478 total aligned reads displayed.
TATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGC > CP009273/3202788‑3202920 | tatTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACg > 1:28905794/1‑68 (MQ=255) ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattggg < 1:15045238‑M1/2‑1 (MQ=255) ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgg > 1:3589510‑M1/67‑67 (MQ=255) atTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACgg > 1:2283567/1‑68 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:11174980/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:8800872/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:17586732/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:5502545/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:21942569/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:25598171/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:18115467/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:23879485/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:19479243/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:16641346/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGGGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:18969874/68‑1 (MQ=255) tCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTg < 1:28329702/68‑1 (MQ=255) atctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggctgagttacctgctgcgtaaaactattgGGt < 1:24112168‑M1/3‑1 (MQ=255) ccTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGc < 1:22976431/68‑1 (MQ=255) acTCGTATTGCTGGTTATTACCGGCTTACTGTTGATGCCCGTTGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGc < 1:6847958/67‑1 (MQ=255) ctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggacgctggcggagttaccggcggcgtaaaactattgGGTGcc > 1:15293952‑M1/63‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:4873891/1‑68 (MQ=255) cTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGcc > 1:10009370/1‑68 (MQ=255) tCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCg > 1:28037327/1‑68 (MQ=255) gTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGa > 1:21118544/1‑68 (MQ=255) gcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGTGCCGGa < 1:7320079‑M1/9‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGaaa > 1:4410011/1‑68 (MQ=255) aTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGaaa > 1:27549398/1‑68 (MQ=255) aTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGaaa > 1:14667998/1‑68 (MQ=255) tGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:10557217/1‑68 (MQ=255) gCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:4018817/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:17135316/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc < 1:29522892/67‑1 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:7694076/1‑67 (MQ=255) ggTGATTACCGGCTTACTGTGGCTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:18615234/1‑66 (MQ=255) tGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGctct < 1:15162608/67‑1 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCg > 1:29826803/1‑68 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCg > 1:13409729/1‑68 (MQ=255) tACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc < 1:5079614/68‑1 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:16991197/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:22046289/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:5363581/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:12037987/1‑67 (MQ=255) ccGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAc < 1:11366635/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:24485799/68‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:21498087/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:6297942/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:15653434/67‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:12228237/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGGGGGGTTGCTTTAAGGGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:21614263/68‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:9561935/1‑68 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:7814346/1‑68 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAg > 1:14417203/1‑63 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:7236952/1‑67 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:18310212/1‑68 (MQ=255) gCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa < 1:2236029/68‑1 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:27024746/1‑67 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:17772266/1‑67 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:2631825/1‑67 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGCCGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:9200354/68‑1 (MQ=255) 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tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:5777882/1‑67 (MQ=255) gtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTaa < 1:26155742/67‑1 (MQ=255) ggctgcgtaaaactattgGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCCCCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa < 1:6128916‑M1/48‑1 (MQ=255) gCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTcc > 1:29282247/1‑68 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:37866/1‑67 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:28799011/1‑67 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:6584477/1‑67 (MQ=255) ttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgcc < 1:16358378/68‑1 (MQ=255) aGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagc > 1:8458845/1‑68 (MQ=255) gTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagcg > 1:1580561/1‑68 (MQ=255) 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cGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagcggccagc < 1:13857388/67‑1 (MQ=255) | TATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGC > CP009273/3202788‑3202920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |