| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614731 = | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/98 | NT | 100% | coding (2180/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614737 = | 0 (0.000) | coding (2186/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 | ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:26905805‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:17290912‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:18075844‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:25085540‑M2/67‑68 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:11808368‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:25629263‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:3754865‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:25056333‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:22412934‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:9360261‑M2/3‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:3711815‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:2864983‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:27243423‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:10160647‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:25242129‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:20294835‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:4916101‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:11220616‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:17535260‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:11221149‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:144919‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:1357789‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggatgatgtctgTCAg > 1:6341751‑M2/64‑67 (MQ=255) tttctcatcatacgtgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:21574916‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:1238286‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:11193766‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:28371621‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:15511518‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgacatggctgatgtctgTCAGcc > 1:10428674‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcaacatacgtgtaatgcaccgccagccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:29746602‑M2/6‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:20677992‑M2/7‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa < 1:5109923‑M2/7‑1 (MQ=255) tctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCat < 1:23955873‑M2/8‑1 (MQ=255) tacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGa < 1:5773327‑M2/16‑1 (MQ=255) gtaatgccccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:24237244‑M2/21‑1 (MQ=255) gcaccggcacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCAcc < 1:7174523‑M2/24‑1 (MQ=255) caccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCggg < 1:14280459‑M2/27‑1 (MQ=255) accgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCggg < 1:14280458‑M2/27‑1 (MQ=255) cccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:1523632‑M2/4‑1 (MQ=255) ctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAg > 1:16193928‑M2/11‑67 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:10035263‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:7183115‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:5853358‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:3994271‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:1066196‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:28108006‑M2/68‑1 (MQ=255) | ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |