| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4034176 | NA (NA) | 24 (0.080) | 8/92 | NT | 9.8% | intergenic (+180/+90) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B |
| ? | CP009273 | = 4034200 | 269 (0.750) | intergenic (+204/+66) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B | |||||
Only 100 of 755 total aligned reads displayed.
GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 | aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCa < 1:17270364/67‑1 (MQ=31) ccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatt > 1:18337192‑M2/1‑57 (MQ=255) ccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTgg < 1:19105421/67‑1 (MQ=39) ccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGgc < 1:27011614/68‑1 (MQ=40) cgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGgc > 1:16244482/1‑67 (MQ=40) aTAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGa < 1:1952425/68‑1 (MQ=255) cTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaaa > 1:955840/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcag > 1:25496418‑M2/1‑45 (MQ=255) gCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcag > 1:29342001‑M2/1‑45 (MQ=255) gCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAAt > 1:3448008/1‑68 (MQ=255) gCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAAt > 1:19386571/1‑68 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc < 1:3132999/68‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc < 1:26341761/68‑1 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:10927569/1‑67 (MQ=255) cAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGAGACGCTGgc > 1:11286421/1‑68 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGcgcg < 1:4565026/67‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:2094565/68‑1 (MQ=255) gCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:679708/1‑68 (MQ=255) gCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:20125199/1‑68 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:28260084/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:16760503/68‑1 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:24319282/68‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:20236405/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:10012328/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:22707254/1‑68 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:7061485‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:9201206‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:7484368‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:2612396‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:12739215‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:20467649‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:14886491‑M2/67‑58 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:13362856‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:4312636‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:15137962‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:14341435‑M2/68‑60 (MQ=255) gATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:28783913/1‑66 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:10367091‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:2674901‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:20776523‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:19705191‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:2968976‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:4023567‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:8365981‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:8796859‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:17542272‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:13125799‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:21417900‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:5276832‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:23245795‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggagggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:22473306‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaattcgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:18783522‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:29051994/67‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:10742706/67‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAc < 1:24042831/67‑1 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgt < 1:23834236‑M2/68‑62 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgt < 1:12103552‑M2/68‑62 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgt < 1:5096044‑M2/68‑62 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgt < 1:27476151‑M2/68‑62 (MQ=255) tGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTAct < 1:21809349/67‑1 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:28521732‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:22894394‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:773756‑M2/1‑6 (MQ=255) gCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt > 1:13673859/1‑68 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:3684937/67‑1 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:21619124/67‑1 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt > 1:26440923/1‑67 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:14146715/67‑1 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:19877376/67‑1 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggggggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:6609125‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgtccgccaccctccgggccgttgct < 1:18589267‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:27732661‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:27284149‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:4933282‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:20595693‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:543489‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:15449010‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:8033227‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:6284231‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:25844027‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:5907656‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:11542579‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:1781624‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:12349354‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:27913075‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:16900635‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:17952864‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:15619971‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:24521731‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:24194981‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:23594141‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:13908636‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtccggcccgccaccctccgggccgttgc > 1:21172350‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:16411067/67‑1 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:25365126/67‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:22223925‑M2/67‑66 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:1114644‑M2/67‑66 (MQ=255) ttctgcataatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgctt > 1:24839098‑M2/1‑2 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc > 1:15857624‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc < 1:11975006‑M2/68‑68 (MQ=255) | GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |