Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ CP009273 246569 247225 657 132 [121] [122] 134 lafU pseudogene, lateral flagellar motor protein fragment

Only 100 of 134 total aligned reads displayed.

GCGTCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGTG  >  CP009273/247207‑247293
                   |                                                                   
acatCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     <  1:16280815/65‑1 (MQ=255)
 catCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAg                    <  1:25486919/66‑1 (MQ=255)
 catCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAg                    <  1:616225/66‑1 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCGATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:11840093/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:7187814/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:5254704/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:18854126/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:20202304/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:20347755/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:5970788/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:20805372/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:28448031/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:16102314/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:15116259/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:7625525/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:24290793/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:25779503/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:24982675/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:8676484/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:27326910/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:23565820/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:22560419/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:1337676/1‑65 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCt                  >  1:27587231/1‑68 (MQ=255)
   tCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGCGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCaaaa                     >  1:4960429/1‑65 (MQ=255)
    ccGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTg                 <  1:12160268/68‑1 (MQ=255)
    ccGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTg                 >  1:11705344/1‑68 (MQ=255)
    ccGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTg                 >  1:4812045/1‑68 (MQ=255)
    ccGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTg                 <  1:26576677/68‑1 (MQ=255)
     cGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTgg                <  1:23974356/68‑1 (MQ=255)
      gATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGa               <  1:1721443/68‑1 (MQ=255)
       aTACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGAt              >  1:21443941/1‑68 (MQ=255)
       aTACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGAt              >  1:9399202/1‑68 (MQ=255)
       aTACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGAt              >  1:1078038/1‑68 (MQ=255)
       aTACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGAt              >  1:16200938/1‑68 (MQ=255)
        tACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGAt              <  1:5735564/67‑1 (MQ=255)
        tACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATa             >  1:22844127/1‑68 (MQ=255)
        tACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATa             >  1:28689436/1‑68 (MQ=255)
        tACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATa             >  1:16781658/1‑68 (MQ=255)
        tACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATa             >  1:22201393/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:26880934/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:7876435/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:24451701/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:7842863/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:6149666/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:26223834/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:900242/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:18002456/1‑68 (MQ=255)
         aCGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATa             >  1:13289314/1‑67 (MQ=255)
          cGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATac            >  1:24720256/1‑66 (MQ=255)
          cGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:22461742/1‑67 (MQ=255)
          cGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:12802136/1‑67 (MQ=255)
          cGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATaa            >  1:17614612/1‑67 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:8657404/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:5508882/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:7074651/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:8731325/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:3133580/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:4502998/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:10393/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:10597847/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:11977688/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:21160297/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:16982878/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:17636057/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:1866018/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:19009377/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGAGAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:26114930/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATCGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:20086511/1‑68 (MQ=255)
           gCTGTATCAATAATTTGGTCAGCATGTGGATAAAGTGGTGAAGCCGCTTGTGCAAAAGCTGGATAagc          >  1:19319093/1‑68 (MQ=255)
            cTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         >  1:25379854/1‑68 (MQ=255)
            cTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         >  1:14564759/1‑68 (MQ=255)
            cTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         >  1:27584981/1‑68 (MQ=255)
             tGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         <  1:10263260/67‑1 (MQ=255)
             tGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         <  1:3594745/67‑1 (MQ=255)
             tGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGGGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagca         <  1:29049343/67‑1 (MQ=255)
              gTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAagcagc       <  1:13939524/68‑1 (MQ=255)
               tATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGa               <  1:13666895/59‑1 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:4106609/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:26137070/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:2546259/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:10847648/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:11158172/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:2393518/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:7331238/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:21921741/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:16468718/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:2096859/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:29556725/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:4748788/1‑68 (MQ=255)
                aTCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGcagcag     >  1:4719805/1‑68 (MQ=255)
                 tCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAgg    >  1:2875864/1‑68 (MQ=255)
                  cAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:1994570/1‑68 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:15080635/1‑67 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:14030636/1‑67 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:5920339/1‑67 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:12462259/1‑67 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGt   >  1:20534445/1‑67 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGTg  <  1:6620583/68‑1 (MQ=255)
                   aaTACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGTg  <  1:20768532/68‑1 (MQ=255)
                   |                                                                   
GCGTCCGATACGCTGTATCAATACTTTGGTCAGCATGGGGATAAAGTGGTGCAGCCGCTGGTGCAAAAGCTGGATAAGCAGCAGGTG  >  CP009273/247207‑247293

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑