| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3701734 = | NA (NA) | 12 (0.030) | 6/96 | NT | 8.0% | intergenic (‑669/+242) | dppA/proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro |
| ? | CP009273 | 3701742 = | 161 (0.340) | intergenic (‑677/+234) | dppA/proK | dipeptide transporter/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
AACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGggaggttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3701789‑3701734‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG > CP009273/3701742‑3701816 AACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCAT < 1:27467847/68‑1AACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCAT < 1:12935936/68‑1AACGAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCAT < 1:37692777/68‑1 GAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCT < 1:15933732/68‑1 GAGCAGGCTTTTTTGCATCTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCT < 1:38618584/68‑1 CTGCAGCTCATGAGGATGAGAACCTCCGGGGGCAGGGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAA < 1:8211131/68‑1 GGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTG > 1:10073847/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGCTGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGGAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:1673811/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:24715285/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:18308640/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:23206033/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:24162465/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:10251015/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:34865591/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:34134913/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:31049263/1‑68 GAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:32058594/1‑68 AGGTTCTCCTCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGCGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:14216365/1‑67 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG < 1:9501172/67‑1 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:30509555/1‑67 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:32762677/1‑67 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:34211261/1‑67 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG < 1:27129516/67‑1 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG < 1:25153941/67‑1 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:38005991/1‑67 AGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGG > 1:38360366/1‑67 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAGAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:6805916/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:33745281/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTC > 1:14429438/1‑68 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:23770906/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:8672176/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:768868/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:37965927/67‑1 GGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGT < 1:5651970/67‑1 GTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGTATTTGGTCG > 1:15033852/1‑68 GTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCG > 1:14956673/1‑68 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGG > 1:36986786/1‑68 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCG < 1:27720773/67‑1 TTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGCTCG < 1:8580170/67‑1 TCTCATCTCCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:7161534/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGCTTCAATAAACCCTGCTAGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:17248366/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTTCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:28026141/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:9639656/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:732614/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:32248935/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:6439188/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:6187894/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:9347112/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:9147886/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:36304109/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT > 1:5181620/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:36591833/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4687539/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:37341486/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4462846/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:37531161/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:4275409/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:39120208/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:38899647/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:17393083/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:2267245/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:21806445/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:21046284/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:19657802/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:19174590/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:19024216/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:18073309/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:17991622/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:22162465/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:16378186/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:15639434/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:14586183/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:13114799/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:12608388/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:11530426/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:10613259/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:31307013/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:30852436/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT > 1:30320465/1‑68 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:23613696/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:24732199/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:2629861/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:2852523/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:29632682/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:28785248/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:294424/68‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGG < 1:25809190/67‑1 TCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCATGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:33538126/68‑1 TCTCAGCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAACAGCCTGATCGTTGAGAAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGT < 1:28884212/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:22990671/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:16196256/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:35512660/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:20124180/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:1378698/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:31833347/68‑1 CTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCTGCTCGTTGAGCAGGCTTTTCGAATTTGGTCGGTG < 1:32414098/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |