| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3832491 = | 418 (0.890) | 27 (0.070) | 8/96 | NT | 9.0% | coding (884/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| ? | CP009273 | 3832524 = | 187 (0.460) | coding (917/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 TTTTGACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:33696123/1‑68TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:28166740/1‑68TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:12054048/1‑68TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:27221262/1‑68TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:27127996/1‑68 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:19493752/1‑67 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:10581084/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:17148299/1‑68 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCGGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:38614552/68‑1 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:16359222/1‑67 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:31381742/1‑67 AACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGC > 1:12817626/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCTGAAGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:24544019/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:18120623/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:7658194/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:1675016/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:18919220/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:12872507/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTAATTTTCTGGCGCG < 1:22581269/68‑1 ACGGTGACGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:22070660/1‑68 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:13982669/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:13372188/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:10135871/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:23923094/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:4382378/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:18422758/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:9019341/1‑67 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:33997948/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:26859351/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:36461868/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:36637608/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:29583359/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:22780645/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:29780196/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:30760694/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:3720295/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:11609395/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:4058675/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:19143956/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:981814/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:14087741/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:15150341/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:16376225/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:15614291/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:36679776/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:15874302/68‑1 GGTGGCGCGGAGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:8451949/68‑1 GTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:2218941/1‑67 GGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATA < 1:29697761/68‑1 CGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAA < 1:7649515/67‑1 CGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAA < 1:2785777/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGT < 1:18220700/68‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:24002477/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:419327/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:37518253/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:26519596/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:9401269/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:27534262/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:10230285/1‑58 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:19110150/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:16256172/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:5932120/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:36445543/68‑1 CTGGCGGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:36703445/68‑1 CTGGCGGGTAACACTCACATATGCCGCGCCGGACGATCTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAAT < 1:19892809/67‑1 TGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:39100965/67‑1 TGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:19821770/67‑1 TGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:37545132/67‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:10971342/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:21092212/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:36679121/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:24584178/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:13336507/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTATTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:5360620/68‑1 cggTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCC > 1:11262557/4‑66 cggTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCC > 1:3737514/4‑66 CGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAG < 1:16103013/67‑1 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:31281342/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:19855058/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:18420415/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:6846514/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:34438885/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:26084726/1‑68 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:23659724/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:30151773/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:33975402/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:9945457/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:37930776/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:2078512/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:36899020/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:23330876/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:38175243/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:26765298/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:8769343/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCCTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:37250292/67‑1 GGCATAAGTGAGAATAACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:5946450/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:31803897/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:15877694/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:38425424/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCG < 1:34870042/37‑1 TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |