| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725679 | NA (NA) | 7 (0.020) | 6/100 | NT | NA | coding (641/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725702 | NA (NA) | coding (664/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 GCGGGTGCTGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:36804761/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:14557636/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:9226972/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:22123094/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:13248225/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:25536663/1‑68GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:27483449/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:875447/67‑1GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG < 1:8008173/67‑1 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:22323043/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:25472569/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:24618048/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:9941632/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:20331427/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:2767722/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:31231752/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:19213631/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:24220216/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:5654812/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:15159674/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:18631378/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:13759526/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11125541/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:11683770/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACGGACCGGGCTGGT > 1:8542759/1‑68 CGGGTGCAGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCCGCCTGGT > 1:7162661/1‑68 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTG < 1:31352891/68‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:26034040/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:24031162/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:24067816/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:10977096/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:24779637/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:9665616/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:9528746/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:7964031/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:29283716/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:38903343/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:19888633/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:16158570/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:16344578/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:16743075/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:18563983/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:21234786/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:28098326/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:6707431/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:696096/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGAGGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:25602880/66‑1 GGGGGCCGGATGCTGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:18993359/67‑1 GGGGGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:26079310/67‑1 GGGGGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:28645267/67‑1 GGGGGCCGGAAGCGGATGAGGAGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:22965227/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:4453697/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:38082417/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:33340731/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:11368282/1‑67 TGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCG < 1:35966566/67‑1 TGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCG < 1:1834191/68‑1 CTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:30167736/67‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:23785590/68‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:32951677/68‑1 GTACCGGGTACTGCCCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:33972659/68‑1 CTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCG > 1:20083665/1‑68 GGTGGAACTTCTGTGTGCTCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:13307/67‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:24236719/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC < 1:22559361/68‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:27478455/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:6721304/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:24754220/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:36425266/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:34960855/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:2367664/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:18994669/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:1963298/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:7438703/67‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:30320254/67‑1 GTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACTAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:32427057/1‑67 GTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:16295454/1‑67 GTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:3191865/1‑67 TGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC < 1:36797153/66‑1 TGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:746454/40‑1 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:29035576/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:23996093/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:29175493/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGC < 1:9801104/67‑1 GAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:5879891/1‑68 GAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:20555070/1‑68 GAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:28828607/1‑68 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:10830807/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:2281499/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:14379612/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:28396738/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:28193581/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:8303021/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:34416556/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:24479801/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:27486759/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:18182865/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:3734229/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < 1:22877117/67‑1 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:36195257/38‑1 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725608‑725679‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |