| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3538010 | 357 (0.760) | 18 (0.050) | 11/94 | NT | 5.1% | coding (194/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| ? | CP009273 | = 3538051 | 364 (0.920) | coding (153/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537935‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGCCTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:694889/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:10209971/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:25126499/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:1189576/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:33421435/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:30448932/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:14211617/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:22846257/1‑67 cgTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:6000041/65‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:23643469/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:7655891/1‑66 gTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGGGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:18939254/66‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTATCCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:20673169/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT < 1:20026790/68‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:17800799/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:32294838/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:4831121/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:20822730/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:2734406/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:28175756/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:26439516/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:25029478/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:17629308/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:28526800/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:29023965/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:30647198/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:15899973/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:32215814/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:457770/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:34874162/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:10070326/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:35176425/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:6341311/67‑1 GCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCCCGGCTTC > 1:15202370/1‑68 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTACCCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:25343344/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCTAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:1970723/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:24962331/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:12053314/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:5276239/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:32473905/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:27094700/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:4131715/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:280943/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:21537941/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:34799748/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:907188/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:1720098/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGCTGCAGCACGGCTTCG > 1:35027180/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCACCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:20116062/68‑1 CCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:31018869/1‑67 TGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCCCTTG > 1:25714968/1‑68 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ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:7004781/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:28182831/1‑67 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:38520125/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:34343783/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:31328892/68‑1 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:3096161/68‑1 GCTTCTGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG > 1:27523939/1‑68 GCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG > 1:35394576/1‑68 CTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG < 1:358091/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:3658461/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:4733777/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |