New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 610426 | 222 (0.470) | 26 (0.060) | 6/96 | NT | 10.4% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
? | CP009273 | = 610453 | 258 (0.640) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
Only 100 of 521 total aligned reads displayed.
GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 | gATTTAGCCTTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:14383054/68‑1 (MQ=255) gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:33662316/68‑1 (MQ=255) gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:38043520/68‑1 (MQ=255) gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:38799350/68‑1 (MQ=255) gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:23112381/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:37626719/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:33227829/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:12391965/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:37340703/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt < 1:16489935/68‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCGGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:13282069/67‑1 (MQ=255) ttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAtt > 1:36245467/1‑68 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCGGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:7348093/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:8053466/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:12536090/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:21977291/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:31569165/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCGTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGCACTACGCCGCCGGATTTa > 1:24663861/1‑66 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:17893066/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:15061218/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCt > 1:28731053/1‑68 (MQ=255) ccTTCCGCTGGCAGCCTTGTGGCGGGGGCGATGGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:1002134/66‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATg < 1:929051/67‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAGTTATCTTTATGc > 1:25258244/1‑68 (MQ=255) tGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCg < 1:24824782/67‑1 (MQ=255) aGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGa < 1:27341610/67‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTgg > 1:1980411/1‑67 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:9078566‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:24064998‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTTGGCTcggc < 1:26714822‑M2/68‑5 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:22536367‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:6196638‑M2/1‑62 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:3903025‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:5678615‑M2/1‑60 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:13656772‑M2/65‑8 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:17572994/67‑1 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:12804453/67‑1 (MQ=255) gATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtag > 1:449156‑M2/1‑57 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:18970566‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:30031579‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:38534484/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGAc < 1:37856133/68‑1 (MQ=255) ttGTGCAACCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggcgtagt > 1:3512394‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:15127890‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:32459816‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccata > 1:27559762‑M2/1‑51 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:28390467/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:10965573/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:12780769/67‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt > 1:18869782/1‑68 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:862006/68‑1 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt > 1:33993200/1‑68 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa > 1:36726351/1‑67 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:3222808/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:14521992/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacg > 1:5899513‑M2/1‑49 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc > 1:23599346/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:31852366/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:11278879/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagccccgtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:8774789‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:12984065‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgagtgcaca > 1:23328327‑M1/1‑14 (MQ=255) actactCCGCCTGATTTATCTTTATGCGTCGAATGTGCTCGGCGGCGCTGACTGCTACCGGACCCGt < 1:15233479/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:6672794‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:2960774‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:3118241‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:28077178‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGCCCCGt > 1:22824271/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:3564479/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:26336855/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:166826/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:4213657/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:13893419/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:2008268/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:26906388/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:20868675/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGCCGCTGACCGCTACCGCACCCGt > 1:11934216/1‑67 (MQ=255) cgccgcCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa < 1:2597208/68‑1 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:18260408‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:553991‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:31259998‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgc < 1:30177744‑M1/66‑60 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacccataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:15471632‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:344813/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:16371051/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:29012454/1‑67 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgccgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccc > 1:19488979‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccc > 1:30633437‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgaataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccc > 1:33530724‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:15858895/1‑68 (MQ=255) cgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccca < 1:24019381‑M1/68‑64 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGGTCAAc < 1:1312271/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:31738587/67‑1 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:21229895‑M1/68‑65 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:17310144‑M1/68‑65 (MQ=255) gccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt < 1:24450057/68‑1 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcctaaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagc < 1:7568884‑M1/67‑66 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcccccgcc > 1:26495833‑M1/1‑2 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:5144272‑M1/68‑67 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:35038427‑M1/68‑67 (MQ=255) | GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |