| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4161825 = | NA (NA) | 24 (0.060) | 7/96 | NT | 100% | intergenic (+141/‑160) | rrfB/murB | 5S ribosomal RNA of rrnB operon/UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, FAD‑binding |
| ? | CP009273 | 4161830 = | 0 (0.000) | intergenic (+146/‑155) | rrfB/murB | 5S ribosomal RNA of rrnB operon/UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, FAD‑binding | |||||
Only 100 of 507 total aligned reads displayed.
GGACAAATCCGCCGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGTTT > CP009273/4161764‑4161897 | aaacggccatccggcaggagggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:28414688‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:10357843‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:9683607‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:4710939‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:28160338‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:27153815‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:17353791‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:11246029‑M2/2‑1 (MQ=255)aaaaggccatccgacaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc < 1:22433252‑M2/2‑1 (MQ=255) aaaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGc > 1:23739050‑M2/66‑67 (MQ=255) aaggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:5602664‑M2/65‑68 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:29775317‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:3347746‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:33857015‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:37409619‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:15909633‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:18446622‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:18189136‑M2/64‑67 (MQ=255) aggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttcatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGccc > 1:9443901‑M2/64‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:21355920‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:26389637‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:4021870‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCg > 1:10825016‑M2/63‑67 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:25851167‑M2/6‑1 (MQ=255) ggccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:38085850‑M2/6‑1 (MQ=255) cgccatccggcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:21929409‑M2/6‑1 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:17610955‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:24827429‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:6411901‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:33777149‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:26846092‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:11980453‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:28792901‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:33197663‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:7903847‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:3134813‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:18768036‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:1213849‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc > 1:24064444‑M2/62‑67 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc > 1:19825694‑M2/62‑67 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggaagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc > 1:7270877‑M2/62‑68 (MQ=255) gccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcggcgtcctGCCCGcc > 1:35959721‑M2/61‑67 (MQ=255) gcatccgtcaggatggacttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCACGcc < 1:37150343‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:35624531‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:4247404‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:4856055‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:38439746‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:14343152‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:27786963‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:13605976‑M2/7‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:12785428‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:30741185‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:5816735‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:6725654‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:626850‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:36200113‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:3530707‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:35882248‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:30298903‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:13763165‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:17024223‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:1674654‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:20905683‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:22794310‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:16537472‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:25608913‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgccgggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:8138024‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccggcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:24563405‑M2/6‑1 (MQ=255) ccatccctcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGc < 1:15119666‑M2/6‑1 (MQ=255) ccacccggcaggagggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcggcctGCCCGc < 1:8790959‑M2/6‑1 (MQ=255) ccaaccgtccggatggccatcagcttaatttgttgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGcc < 1:24268930‑M2/7‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCAt < 1:34132038‑M2/9‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCAt < 1:37721042‑M2/9‑1 (MQ=255) catccgtcaggatggccttctgcttaattagatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCa < 1:12569171‑M2/8‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgtcccctggcagttaatggcgggcgtccgGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCaa < 1:32017975‑M2/26‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgctgcctggcagtttatggcgggcgtccgGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCaa < 1:34536241‑M2/26‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCaa < 1:32671081‑M2/26‑1 (MQ=255) ttctgcgtaatttgatgcctggcagtttagggcgggcggcctGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCaa < 1:7428240‑M2/26‑1 (MQ=255) ttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTaa < 1:29232258‑M2/31‑1 (MQ=255) aCGCCCGTCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:7134560/1‑68 (MQ=18) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGGCGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:38579257/1‑68 (MQ=18) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGCCGGATGGGCTTTTTGCGt > 1:19467529/1‑68 (MQ=255) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCg < 1:13292871/67‑1 (MQ=31) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:1411228/1‑68 (MQ=33) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:38987871/1‑68 (MQ=33) aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGt > 1:13362123/1‑68 (MQ=33) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:7714483/1‑67 (MQ=18) cgcccgccATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGtg > 1:10109506/1‑67 (MQ=18) 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GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:35130114‑M2/68‑3 (MQ=255) GCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGcgtgg < 1:2996334‑M2/68‑3 (MQ=255) | GGACAAATCCGCCGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCGTTT > CP009273/4161764‑4161897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |