| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4607857 = | 486 (1.030) | 11 (0.030) | 6/96 | NT | 2.6% | coding (718/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked |
| ? | CP009273 | 4607913 = | NA (NA) | coding (774/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 641 total aligned reads displayed.
CGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCGTA > CP009273/4607847‑4607980 | cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:34425907/67‑1 (MQ=255)cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:11343346/67‑1 (MQ=255)cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:16566638/67‑1 (MQ=255)cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct > 1:38257085/1‑68 (MQ=255)cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct > 1:29938079/1‑68 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGTCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:37495365/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:34780655/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct > 1:29136387/1‑67 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:27406518/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:1378220/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:26997574/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct > 1:2559940/1‑67 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCGGGCATGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:5856735/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCTGctac < 1:31014187/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:35889216/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:28616140/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:8278390/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:5318421/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:10011453/67‑1 (MQ=255) tCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctacta < 1:7356031/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:37075401/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:17228019/68‑1 (MQ=255) agtagctgctggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACtaa < 1:36070243‑M2/7‑1 (MQ=255) agtagctgctggcgctcttaccggcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACtaa < 1:15175326‑M2/7‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:12968981/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:15856535/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:6334042/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:13252462/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:38573223/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:32013372/1‑68 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:14701061‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:4597643‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:12375717‑M1/1‑65 (MQ=255) TGCTGGCAAGCCTGCTGAACGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGa < 1:19473962‑M1/68‑1 (MQ=255) TGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGa > 1:31623922‑M1/1‑68 (MQ=255) gtCAAGCCTGCTGAAAGGGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAATTAAGATGCt > 1:8807723‑M1/3‑68 (MQ=255) ggcgctcttaccggcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCt < 1:20485759‑M2/17‑1 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:23460715‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:36429739‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt < 1:7086695‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:28257253‑M1/1‑68 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCttt < 1:27150532‑M1/68‑1 (MQ=255) atccTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc < 1:35219545/66‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:17982408/1‑68 (MQ=255) aGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:3272071/1‑68 (MQ=255) tcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:23958131‑M2/22‑1 (MQ=255) gCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:7860953/1‑67 (MQ=255) ttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGcc < 1:3677602‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:10614319/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:25826947/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:16824210/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGcc < 1:21700151/68‑1 (MQ=255) tgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAt > 1:3302941/1‑68 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:3556800/67‑1 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGGCGACGGGAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:9350847/67‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:33324085/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:6652281/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:7708667/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:963091/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:20074295/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:21991428/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:28749712/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:1846311/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:11782472/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:17609180/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCACCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:22750078/68‑1 (MQ=255) gcTGGGGCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:33641066/68‑1 (MQ=255) gggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:1452025/68‑1 (MQ=255) gTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa > 1:24264351/1‑68 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:1534817/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:5568303/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:4895984/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:24497682/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:1495830/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:33938582/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:10991314/67‑1 (MQ=255) aCGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGATACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCa > 1:27990765/1‑68 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:8651818/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:38382678/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:3955756/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:19117737/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:29584099/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:5075369/68‑1 (MQ=255) gCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTAACAgg > 1:30836136/1‑67 (MQ=255) cGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg > 1:4178534/1‑66 (MQ=255) tAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag > 1:34075757/1‑68 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgaga < 1:38698491/68‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag < 1:21467249/67‑1 (MQ=255) gcgcCTGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTTATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:26174362/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:22457413/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:3772233/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:23061976/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:27698526/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:30481213/67‑1 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:4395698/1‑67 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCAGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:26761334/1‑67 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTACGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTAt < 1:13586292‑M2/59‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa < 1:24782654‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTAt < 1:18809793‑M2/59‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCg > 1:21303894‑M2/3‑68 (MQ=255) | CGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCGTA > CP009273/4607847‑4607980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |