| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1870380 | 374 (0.790) | 23 (0.060) | 9/94 | NT | 6.3% | coding (451/1182 nt) | yeaN | putative transporter |
| ? | CP009273 | = 1870397 | 372 (0.940) | coding (468/1182 nt) | yeaN | putative transporter | |||||
Only 100 of 561 total aligned reads displayed.
TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGC > CP009273/1870330‑1870464 | cGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCg < 1:38549709‑M2/68‑2 (MQ=255) ccAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgt < 1:26755098‑M2/67‑3 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:31170138‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:27087710‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:27890255‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:18918245‑M2/66‑6 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccg > 1:25761562‑M2/1‑60 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc > 1:3816211‑M2/1‑60 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGTAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:33767781/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:38678029/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:36248485/68‑1 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:30943443/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:32900490/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:15240008/1‑68 (MQ=255) ggCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagct > 1:29675220‑M2/1‑54 (MQ=255) ggCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCttt > 1:26156146/1‑68 (MQ=255) gcATATTCCCTGACACTGGGAGCGGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcc > 1:36632737‑M2/1‑51 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcc > 1:33385156‑M2/1‑51 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGa < 1:15538369/67‑1 (MQ=255) atatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctccca > 1:12384167‑M2/1‑49 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:28985891/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:23222191/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:9606554/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:34461409/68‑1 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGtt < 1:13426859/68‑1 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:31727541/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:25635966/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:216797/1‑68 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:10999582/1‑66 (MQ=255) gACAATGGGCGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCgtgccgctgcagctcccattgtcaggga > 1:39102812‑M2/1‑40 (MQ=255) actaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:36432378/4‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:30514905/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:35368949/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:6452291/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:250262/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:26526973/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:1842693/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:21382316/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:20092781/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:17228445/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:20617708/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTaggctg > 1:16187570/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTATGAACGGTTTtggctg > 1:11588350/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGATGAAGCGGCACTGGGAACGGCTATGGTCGTGCCGCTGGATTTGAACGCTTTtgtctggc > 1:29940706/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAgg > 1:28282609/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:15022434/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:4704676/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCATTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:13746774/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc < 1:20867628/67‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:24728038/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCGCGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc < 1:25934623/67‑1 (MQ=255) gCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc > 1:14252479/1‑68 (MQ=255) cTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGcgcg > 1:7749294/1‑68 (MQ=255) tGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc < 1:33995790/66‑1 (MQ=255) gCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:22379137/68‑1 (MQ=255) aGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt > 1:23391767/1‑66 (MQ=255) aGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTg < 1:429553/67‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGCACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa > 1:5995975/1‑68 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:28709051/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:11263886/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:37922457/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:23988267/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:14555698/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:696379/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:9265873/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:31442376/65‑1 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:12153863/1‑67 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:5589266/1‑67 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa < 1:10030130/68‑1 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:8173028/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:8785895/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:1776791/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:34907742/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:24540052/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgtg > 1:19142588/1‑68 (MQ=255) gcGGCTATGGTCGGGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:18728099/66‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:21971082/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:11857393/68‑1 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt > 1:7548616/1‑67 (MQ=255) aTGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc < 1:10673545/68‑1 (MQ=255) aTGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc < 1:22841198/68‑1 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCt > 1:33180450/1‑53 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:506999/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:4794150/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:8452121/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:10187202/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:22710181/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:14067893/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:3581259/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:14791669/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:21120459/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:16665854/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:1809520/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:37448427/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:37060345/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:1309527/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:32259404/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:19786303/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:27711154/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:20373312/1‑66 (MQ=255) | TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGC > CP009273/1870330‑1870464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |