| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2787742 = | 483 (1.020) | 41 (0.100) | 8/96 | NT | 9.9% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | CP009273 | 2787778 = | 329 (0.810) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Only 100 of 559 total aligned reads displayed.
GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTTT > CP009273/2787711‑2787845 | gccaacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggct < 1:14516429‑M2/1‑1 (MQ=255)gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:24589694/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:24832856/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:11744300/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:39128514/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:7983647/68‑1 (MQ=255) aaacatccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTAc < 1:33233406‑M2/3‑1 (MQ=255) catccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtgg < 1:5599749‑M2/6‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGTCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:31936796/68‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:4724028/68‑1 (MQ=255) atccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggt < 1:215769‑M2/7‑1 (MQ=255) ccAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtg < 1:24424016/68‑1 (MQ=255) ccgcataatcatcaccaccactagcccggctaacatataggccagtaataccgccgggcTACttgtgg < 1:11221415‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggctaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:27944146‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtactaccgccgggcTACtggtgg < 1:1758723‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:19660414‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:12469610‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgcataatcaaaaccaccagtagcccggcgaacacataccccagtaataccgccgggcTACtggtgg < 1:7171035‑M2/9‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:4984593/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:28858927/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:1336013/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:27743553/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:27192911/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:34312639/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:1782164/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:12140920/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:38733811/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:10459560/68‑1 (MQ=255) 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ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:26112648‑M1/59‑1 (MQ=255) cGAAGCGGGACCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa < 1:37328087/68‑1 (MQ=255) accagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGAt < 1:11017498‑M1/61‑1 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATg < 1:8979480/67‑1 (MQ=255) gCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGtt > 1:25663174/1‑68 (MQ=255) gCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGtt > 1:25093218/1‑68 (MQ=255) gtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg < 1:330630‑M1/65‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCgg < 1:35079177‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGaaa < 1:32177793‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATg < 1:36333073‑M1/68‑1 (MQ=255) 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gggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTc > 1:30753301‑M2/5‑68 (MQ=255) gggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTc > 1:6183381‑M2/5‑68 (MQ=255) | GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTTT > CP009273/2787711‑2787845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |