| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614228 | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/90 | NT | 100% | coding (1677/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614368 | 0 (0.000) | coding (1817/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
AAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614305‑3614435 | gCCATTAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggt > 1:32821931‑M2/1‑52 (MQ=255) gAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtc < 1:35723799‑M2/68‑22 (MQ=255) acaTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATtgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccgg < 1:2349853‑M2/68‑41 (MQ=255) acaTCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccg < 1:4715777‑M2/68‑41 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgcagc < 1:29656682‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:23110370‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:19918485‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:30695125‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:32063511‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:29468877‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:2908393‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:16852477‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:22399281‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:22440930‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:3318825‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:22697330‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:8387104‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:33937122‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:9274340‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:28950579‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:13309520‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:24644486‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:35897033‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:7754245‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:26241817‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:26561694‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:32503745‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:33273192‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:37943516‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:31064241‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:15712768‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:16228244‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:18748714‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatgggcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:20941432‑M2/1‑11 (MQ=255) ccgccgTCATtgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:12671567‑M2/68‑59 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:1746886‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:29584481‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:4377520‑M2/1‑9 (MQ=255) gcggTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:10973940‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:1046141‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:3350029‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35055162‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35149543‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:28829039‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:31760389‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:25290690‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:21096727‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:1831962‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:20337000‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggatacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:20716129‑M2/67‑60 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:27160815‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:1343468‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:17682413‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:19479168‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:27098789‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:36629456‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:10642055‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:34226359‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:14564136‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:809470‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:18516479‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:21121008‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:22090013‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:2434354‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggcgaagctcagc > 1:11290505‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacggggtacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:9199637‑M2/1‑6 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataacctgaacagtcggtgaagctcagca < 1:3021950‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaac > 1:20042332‑M2/1‑3 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaac > 1:26353111‑M2/1‑3 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:14993105‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:7877519‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaac > 1:6709035‑M2/1‑3 (MQ=255) aTctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:11878‑M2/68‑67 (MQ=255) tctgccggaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:27842956‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagtaactta > 1:8764739‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:748485‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:5902935‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga < 1:10135969‑M2/68‑68 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:6042978‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:4282214‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:9473144‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:38791082‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:38504785‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:36446510‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:13599828‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:14295042‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:36007601‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:32737441‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:30486678‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:1442517‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:25779915‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:15133460‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:38086626‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:10720193‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:14807944‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:27903936‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:5454133‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:36134877‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:37369575‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctaagcaactga > 1:28538229‑M2/1‑1 (MQ=255) | AAGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614305‑3614435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |