| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 930,957 | C→G | 6.5% | P760A (CCG→GCG) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 930,957 | 0 | C | G | 6.5% | 1243.5 / 15.2 | 398 | P760A (CCG→GCG) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (147/221); new base G (25/4); total (172/226) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 431 total aligned reads displayed.
ACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930890‑931024 | ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTcc > 1:17065987/1‑68 (MQ=17) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTcc > 1:38468818/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTcc > 1:1008659/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:8426181/1‑68 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:38771369/1‑68 (MQ=255) tACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTccgcc > 1:23265582/1‑67 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTGcgccgc > 1:35702702/1‑68 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgca > 1:15795505/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:11519959/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:26004105/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgcag > 1:29356471/1‑67 (MQ=14) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTGCgccgcag > 1:27038458/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcag > 1:28266214/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:14359109/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:5528894/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:21706690/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:1657554/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTGCgccgcagcc > 1:33960024/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcagcc > 1:27712639/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:9266205/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:27911566/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:7755276/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:32721263/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:19079342/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:36358204/66‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTGCGccgcagccgcag > 1:5715640/1‑68 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:1990603/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:21327841/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:24405556/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:20110339/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:34019964/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:34606802/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:14984409/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:10339533/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCTGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:10992224/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:19740093/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:39022067/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:4459670/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGGTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:28570441/68‑1 (MQ=255) aacaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTa < 1:23843424/67‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATc < 1:36883171/68‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATc < 1:17297653/68‑1 (MQ=255) acaacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATc < 1:12144344/68‑1 (MQ=255) caacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGAAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTAtaa > 1:31647528/1‑66 (MQ=255) aacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcc > 1:22930926/1‑66 (MQ=255) aacCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcag < 1:34743267/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:10647946/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:31122745/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:33738287/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:33544534/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:22515112/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:14651377/68‑1 (MQ=255) gCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCcaca < 1:32129903/68‑1 (MQ=255) ccACCGCAGCAGCAATAGCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCTGCCGCAGTATCAGCAGCcaca < 1:33291345/67‑1 (MQ=17) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAc > 1:13295216‑M2/1‑67 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGGATCAGCAGCCACAAc < 1:39117173‑M2/68‑2 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAATAGCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAc > 1:27439497‑M2/1‑67 (MQ=255) cGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAca < 1:29112769‑M2/67‑3 (MQ=255) gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAcagc > 1:18221771‑M2/1‑64 (MQ=255) gcagcaATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCACCAGCAACAAcagccgg < 1:8078852‑M2/68‑8 (MQ=255) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAAcagccg > 1:20389654‑M2/1‑59 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgcg < 1:12872578/68‑1 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgc > 1:7252830/1‑67 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgc > 1:28852052/1‑67 (MQ=255) tatCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGcgcc > 1:30165038/1‑68 (MQ=255) tCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCAGGTTGcgccgc > 1:6900058/1‑68 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCCGCGCGATCATCCGGTTGggccgc > 1:14010555/1‑67 (MQ=17) cagcagCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCa > 1:35411155/1‑68 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCATCCGAAGTATCAGCAGCCCCCACAGCCGGTTGCGACGCa > 1:24760852/1‑67 (MQ=17) accagcCGCAACAACCAGTGCCGCCGCAGCCGCAGTAGCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAg < 1:25321766/66‑1 (MQ=18) gcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAg > 1:20739427/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCACCTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:30510253/68‑1 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc < 1:35875001/68‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc < 1:6483583/67‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:593565/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:2639827/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:25674919/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:37294331/66‑1 (MQ=255) gcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATcccc > 1:9887658/1‑66 (MQ=255) gcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcac > 1:17946809/1‑68 (MQ=255) ctcaaccaCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:16187638/65‑1 (MQ=255) cGCAACTACCCGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:22041180/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCTGTGCCGCGGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:8762487/68‑1 (MQ=18) cGCAACAACCAGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATAAGCAGCCAGAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:34964909/67‑1 (MQ=18) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:34121559/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:37555849/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:11908233/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:5095300/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:15680661/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:15879732/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat < 1:33424366/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat < 1:21519473/68‑1 (MQ=255) aacatcCAGTTCCCGCGCAGCCTCATTATCATCAGCCTCAACATCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:31450286/65‑1 (MQ=16) ccAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagca > 1:30306091/1‑68 (MQ=255) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagcag < 1:468085/68‑1 (MQ=255) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagcag < 1:18823927/68‑1 (MQ=255) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATcagcag < 1:29694968/68‑1 (MQ=255) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCTGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCg < 1:3243501/67‑1 (MQ=255) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCCCAGCCACAAGATCAGCAGCCGc > 1:13509419/1‑68 (MQ=255) ccgccgCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGca < 1:19330865/68‑1 (MQ=255) | ACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930890‑931024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |