| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 930,950 | A→C | 7.8% | Q757H (CAA→CAC) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 930,950 | 0 | A | C | 7.8% | 1007.8 / 5.8 | 415 | Q757H (CAA→CAC) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (141/206); new base C (31/4); total (203/212) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.27e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
TTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATC > CP009273/930883‑931014 | ttgttgAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGcaacaa < 1:25990797/68‑1 (MQ=255) tgttgAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGcaacaa > 1:2481493/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGtt > 1:38113076/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCCGCCGGCACATCCAGTTc > 1:37491828/1‑68 (MQ=18) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGtt > 1:29197652/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGtt > 1:27849716/1‑67 (MQ=255) aCCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGtt > 1:27242328/1‑67 (MQ=255) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACCACCAGTTcc > 1:36347512/1‑68 (MQ=17) ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTcc > 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aacaacCATTGCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAatat < 1:15631129/68‑1 (MQ=255) | TTGTTGAACCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATC > CP009273/930883‑931014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |