New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3538010 | 287 (0.810) | 16 (0.050) | 14/94 | NT | 5.9% | coding (194/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
? | CP009273 | = 3538051 | 274 (0.920) | coding (153/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:19872634/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:16257808/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:7184337/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:20024272/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTAGCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:8105700/1‑67 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAAGGGCATTATCAGCTTCCTGTTGCAGCACG > 1:24705577/1‑67 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:7151846/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT < 1:17537141/68‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:3447907/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:167702/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:3280724/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:19115257/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:19105604/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:23671389/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:23722229/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:18209498/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:24702001/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:25326593/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:2696924/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:3727045/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:8846631/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:12962259/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:8702099/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:11393257/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACCCCAGCCTAACCAAATGGCTCTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:5071440/67‑1 TGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:3376749/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATTGCTTTATAAGGTGCATGTTGCACCACGGCTTCG > 1:9598510/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCCGCACGGCTTCG > 1:14527914/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGTACGGCTTCGG < 1:6924972/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:22335241/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:22232756/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:21596243/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:8473630/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:25867928/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:4202563/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:23951749/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:14172873/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:19362968/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:15979988/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:18412177/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:18007652/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:18216717/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:355238/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:28527671/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG < 1:6201801/67‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:12048368/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:5767743/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:23959734/1‑67 ACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG > 1:7556439/1‑67 ACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG > 1:17476228/1‑67 TCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGGGGAGCCGGGGATTTG > 1:23340249/1‑68 GCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCCCGGCTGCGGGCGGAGCCGGGGAGTTGGTGC > 1:6144597/1‑68 CCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCG > 1:12929774/1‑68 CCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCG > 1:28177852/1‑68 CTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGg > 1:20729961/1‑67 AACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:1004011/1‑64 CCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGTTTTGGTGGGCTGTg > 1:1975216/1‑67 TGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTGGCCGGGGGGTTGGTGCGCTGGCCCTTG > 1:13726671/1‑68 CAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGGTGTCACTTGCTGATATG > 1:3039581/1‑67 AGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGTTTTGGTGCGCTGTGACTTGCTGATATGG > 1:25623557/1‑67 GCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAA < 1:13215435/68‑1 GTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCG > 1:18825731/1‑68 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:15374446/1‑67 CACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:6454533/1‑68 CACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:27644807/1‑68 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:122105/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:12401165/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:8492219/1‑67 ACGGCGTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:6360052/1‑67 CGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:13697162/68‑1 CGGCTGCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAAC < 1:15699898/68‑1 GGCTTCGGGGGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACA < 1:6846520/68‑1 CTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG < 1:20211686/67‑1 gTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:5213216/66‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:6168384/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:12649629/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:7758595/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:10523932/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:10325070/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:1021733/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:3783462/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:18354680/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:22660594/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:18302250/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:25667976/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:2589214/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:27983250/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:3278808/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:14025066/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:8993790/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:28308518/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACGGGCTGATCTGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG > 1:22250982/1‑67 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:21561993/68‑1 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGCGCTGCAACAGGCA < 1:26587665/68‑1 CGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCAC < 1:2711053/68‑1 GGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATTTGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < 1:25580561/68‑1 GGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCAC < 1:5962177/67‑1 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:1810843/1‑65 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:2577761/1‑65 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:19421549/1‑65 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |