| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 170 (0.480) | 15 (0.050) | 7/96 | NT | 7.4% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 232 (0.770) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328099‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCCC > CP009273/4328055‑4328121 TTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATT < 1:15502612/68‑1 TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTA < 1:11947495/68‑1 TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATT > 1:25719658/1‑67 TACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATATCATTAC < 1:4777327/68‑1 TACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC < 1:8130828/68‑1 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:19602041/1‑67 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:10007632/1‑67 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CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:4763743/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:29095085/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:3139509/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:3182401/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:32910/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:3887296/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:4236928/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:10364130/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:12088021/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:9216675/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:13799021/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:16299583/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:15660626/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:14403774/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:864588/1‑67 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:25840363/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:6107032/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:19699851/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:13476713/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:648591/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:21740046/68‑1 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:12829209/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:5322258/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:26030635/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:27106920/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:9314072/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:18948595/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:18498793/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:1790398/1‑67 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:14331689/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:14393530/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:19053975/67‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:9333284/68‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGA < 1:4988794/67‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGA < 1:9336224/67‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGA < 1:18935523/67‑1 GCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGA < 1:29002159/67‑1 AAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGG < 1:10806935/68‑1 AAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATAACGCCTTCAGCGGAATAGTGG < 1:26983007/68‑1 AACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACG < 1:24983107/67‑1 atcCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATACCGCCGTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACG < 1:20421179/65‑1 aCCGCTCAAGGCGTAATTCTTAAAAAAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:13929422/67‑1 TCCGCTGAAGTCGTAATTGTTAAAATAACATTACCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:1935563/68‑1 GAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACCCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAAC < 1:26418216/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |