| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1870380 | 276 (0.780) | 12 (0.040) | 6/94 | NT | 5.0% | coding (451/1182 nt) | yeaN | putative transporter |
| ? | CP009273 | = 1870397 | 222 (0.750) | coding (468/1182 nt) | yeaN | putative transporter | |||||
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 | cGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACACTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTc < 1:27501439/67‑1 (MQ=255) gCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgt > 1:14477118‑M2/1‑66 (MQ=255) cAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgc > 1:10045808‑M2/1‑64 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:21543812‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:4686367‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:13237372‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:6444519‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:16262959‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:21201623‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:9324345‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:1896012‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:10211080‑M2/66‑6 (MQ=255) gcaacgcgccttgcccgccaaaaccgttcaaagcCAGCGGCGCGGGGGTCGGCTTTGGTCGTGccggt < 1:26331451‑M1/34‑3 (MQ=255) ttACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctg < 1:11309435‑M2/68‑10 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:9012164/68‑1 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:18399124/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:15736939/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:7290149/1‑68 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:7865743/1‑68 (MQ=255) ggCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagct > 1:2519307‑M2/1‑54 (MQ=255) ggCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCttt > 1:10722934/1‑68 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCCCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGa > 1:25024989/1‑67 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGa < 1:12252857/67‑1 (MQ=255) tatTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACgg < 1:2415621/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:4947570/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:5330021/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:24456496/68‑1 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGCGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcccattgt > 1:26813533‑M2/1‑46 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGtt > 1:4019019/1‑68 (MQ=255) ttCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCGATGGTCgtgccgcggcagctcccattgt > 1:9595767‑M2/1‑46 (MQ=255) tCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGttt > 1:23935103/1‑68 (MQ=255) cccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGtttt > 1:18532073/1‑68 (MQ=255) ccaaaaccgttcaaagcCAGCGGCACTGGGATCGGGTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg < 1:14029533‑M1/51‑1 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:18124075/1‑68 (MQ=255) ccTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:29234704/1‑68 (MQ=255) cTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcccattgtcagg > 1:21718166‑M2/1‑42 (MQ=255) cTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtgg < 1:28374216/68‑1 (MQ=255) gACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:16899649/1‑65 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:7709580/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:5779915/1‑68 (MQ=255) cAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctgg < 1:20436156/68‑1 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGCACGGTTTtggctggc > 1:25501605/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:23500473/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:11564419/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:20755379/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:18294021/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:13574747/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:15496739/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:8461666/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc < 1:517351/67‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:428151/1‑67 (MQ=255) gCTGCAGCGGCACTGGGAGCGCCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc < 1:22163145/68‑1 (MQ=255) tGCCGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCgggccgctgcagctcccattgtcagggaatatgcgccg > 1:19647935‑M2/1‑28 (MQ=255) gCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:16149257/68‑1 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt < 1:19366886‑M1/66‑1 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTg > 1:12892778‑M1/1‑67 (MQ=255) AGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTg > 1:3314463‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:16578067‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:3488330‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:28854474‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:8288749‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc > 1:10325613‑M1/1‑65 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa < 1:13885293‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa < 1:6776398‑M1/68‑1 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTtgcttat > 1:2913407‑M1/1‑64 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:17228768‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:20567669‑M1/1‑67 (MQ=255) CACTGGGAGCGGCTATGGGCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:23271981‑M1/1‑67 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:11115945/1‑68 (MQ=255) gATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtg > 1:3769858/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgtg > 1:13655065/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:19490902/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:20181826/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGATTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:27670273/67‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:11930213/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:6250867/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:19999811/68‑1 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:24659956/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:8085607/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:8651974/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:16625559/1‑68 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt > 1:22777228/1‑67 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:2141222/67‑1 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt > 1:5593314/1‑67 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCGGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:21962157/67‑1 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:1299957/1‑66 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:12484386/1‑66 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:14155748/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:12726175/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:23773554/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:2579187/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:26234920/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:17472742/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:3077882/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:15129848/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct < 1:27977522/67‑1 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:18799761/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:27133565/1‑67 (MQ=255) cGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:6159016/1‑66 (MQ=255) cGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTctg < 1:17925883/67‑1 (MQ=255) | TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |