| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4034176 | NA (NA) | 23 (0.080) | 7/92 | NT | 8.4% | intergenic (+180/+90) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B |
| ? | CP009273 | = 4034200 | 306 (0.870) | intergenic (+204/+66) | rrfA/mobB | 5S ribosomal RNA of rrnA operon/molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein B | |||||
Only 100 of 784 total aligned reads displayed.
GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 | aCGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGAAGGCCTTTTTGCAt > 1:11445369/1‑68 (MQ=18) tAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaa < 1:24229492/68‑1 (MQ=255) aaCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaa > 1:19198619/1‑68 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaa > 1:3371401/1‑68 (MQ=255) aCTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTCACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGaaaaa > 1:18072018/1‑68 (MQ=255) cAGGCATCAAATTCAGCAGACGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagt > 1:4358009‑M2/1‑43 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagt > 1:15703054‑M2/1‑43 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATg > 1:4003449/1‑67 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATg > 1:16376492/1‑67 (MQ=255) cAGGCATCAAATTAACCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagt > 1:18757089‑M2/1‑43 (MQ=255) aGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGcc > 1:10003243/1‑68 (MQ=255) ggCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCg > 1:19398768/1‑68 (MQ=255) aTCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGAt < 1:27345005/68‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc > 1:20823371/1‑68 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc < 1:16150962/68‑1 (MQ=255) aTTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGAc > 1:26832194/1‑68 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:26214541/1‑67 (MQ=255) gCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTg > 1:14465359/1‑67 (MQ=255) cAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGgc > 1:15239204/1‑68 (MQ=255) aGGCCATCCTGCCGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:13897670/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAACAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:27911897/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:27248800/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:3721519/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:1304380/68‑1 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:17535407/68‑1 (MQ=255) cATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:12728828/68‑1 (MQ=255) cATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:8819114/68‑1 (MQ=255) ccTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATcc > 1:1854168/1‑68 (MQ=255) ccTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATcc > 1:249620/1‑68 (MQ=255) ccTGACGGATGGCCTTTTAGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATcc < 1:13437726/68‑1 (MQ=255) cTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCa > 1:171270/1‑68 (MQ=255) tGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAg < 1:5780388/68‑1 (MQ=255) gACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGc < 1:14853275/68‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:26000324/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:20312509/1‑68 (MQ=255) cGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCt > 1:21964556/1‑68 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:16711173‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:460580‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:20721567‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:28539227‑M2/67‑58 (MQ=255) ggATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg < 1:21134796‑M2/67‑58 (MQ=255) gATGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc < 1:8418773‑M2/68‑60 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggctgtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:1470416‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctctggg > 1:7969349‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:25129614‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:23113203‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:29184750‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:6811536‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:15468645‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:9314077‑M2/68‑61 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggcc > 1:28871502‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:6323965‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccggg > 1:23437267‑M2/1‑8 (MQ=255) aTGGCCTTctgcttaatttgatgcctggaagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccg < 1:11750442‑M2/68‑61 (MQ=255) tGGCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgt < 1:10770611‑M2/68‑62 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:23633278‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:19551099‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:8127111‑M2/1‑6 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggctgtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:7306659‑M2/1‑5 (MQ=255) gCCTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcccccctccgggccgtt < 1:17341594‑M2/67‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:4881009‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:22471280‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt < 1:5999540‑M2/66‑63 (MQ=255) ccTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCtt < 1:25522778/67‑1 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:25832723‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:26681317‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:14189850‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:16804724‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:18416937‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:19089575‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:20153094‑M2/68‑66 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:5469665‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:350005‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:9515516‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:5076891‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:10217287‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:28220584‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:10929843‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:11135821‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:11975485‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:13358290‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:15039803‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:19768986‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:2162772‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:22640111‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:2451773‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:24735420‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:2539648‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:26292748‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:27781001‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:3125773‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTctgcttaatttgatgcctggcagttcatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgc > 1:20556043‑M2/1‑3 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:15890854/67‑1 (MQ=255) cTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTg < 1:12385440/67‑1 (MQ=255) tttttGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCt > 1:21362630/1‑68 (MQ=255) tttttGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCt < 1:9762005/68‑1 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:22221004‑M2/67‑66 (MQ=255) ttctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgct < 1:10493319‑M2/67‑66 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc > 1:7051705‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcttaatttgatgcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttc < 1:7718453‑M2/68‑68 (MQ=255) | GGGCAGGACGCCCGCCATAAACTGCCAGGCATCAAATTAAGCAGAAGGCCATCCTGACGGATGGCCTTTTTGCATTGGCGCAGAAAAAAATGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCAGCCTACTCTTGCTT > CP009273/4034133‑4034267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |