Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ CP009273 2597319 2598078 760 186 [118] [97] 129 hyfC hydrogenase 4, membrane subunit

Only 100 of 129 total aligned reads displayed.

CAGAAAACACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGG  >  CP009273/2598047‑2598146
                                |                                                                   
tacaaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  <  1:25972521/65‑1 (MQ=255)
 acaaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  >  1:14108191/3‑67 (MQ=255)
   aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  >  1:2048293/1‑65 (MQ=255)
   aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  >  1:231385/1‑65 (MQ=255)
   aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  >  1:24931132/1‑65 (MQ=255)
   aaaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCtt                                  >  1:12060347/1‑65 (MQ=255)
    aaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCCCCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgct                               >  1:17099415/1‑67 (MQ=255)
    aaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgct                               >  1:15433079/1‑67 (MQ=255)
    aaaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgct                               >  1:20180084/1‑67 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             <  1:16731428/68‑1 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             <  1:25388516/68‑1 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             <  1:27571917/68‑1 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             >  1:26027118/1‑68 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             <  1:16766208/68‑1 (MQ=255)
     aaCACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             <  1:25473155/68‑1 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             >  1:8298470/1‑67 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             >  1:23698653/1‑67 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             >  1:20838754/1‑67 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTtgctgc                             >  1:16159297/1‑67 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTgcg                            <  1:1197546/68‑1 (MQ=255)
      acacGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTgcg                            <  1:11487902/68‑1 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:23457381/1‑68 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:8475663/1‑68 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:22540199/1‑68 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:18458546/1‑68 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:11996320/1‑68 (MQ=255)
        acGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCt                          >  1:17916477/1‑68 (MQ=255)
         cGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCtt                         >  1:633867/1‑68 (MQ=255)
          gCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                        <  1:22731090/68‑1 (MQ=255)
          gCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                        <  1:11338834/68‑1 (MQ=255)
          gCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTg                        <  1:28160543/68‑1 (MQ=255)
           cTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGc                       >  1:8326933/1‑68 (MQ=255)
           cTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGc                       >  1:23071644/1‑68 (MQ=255)
               cACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATgg                   >  1:19220081/1‑68 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  >  1:4717351/1‑68 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  >  1:19212231/1‑68 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  <  1:8216599/68‑1 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  <  1:23315213/68‑1 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  <  1:5830339/68‑1 (MQ=255)
                aCGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATggg                  <  1:13308046/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:1908242/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:28900089/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:12376191/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:1260569/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:2929855/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:15168138/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:5232182/68‑1 (MQ=255)
                 cgcgGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGt                 <  1:4358819/68‑1 (MQ=255)
                    gggCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtct               <  1:10566234/67‑1 (MQ=255)
                    gggCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtct               <  1:11798928/67‑1 (MQ=255)
                    gggCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtct               >  1:5885113/1‑67 (MQ=255)
                    gggCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtct               >  1:21346954/1‑67 (MQ=255)
                     ggCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtct               >  1:20616249/1‑66 (MQ=255)
                       cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct            <  1:23472668/67‑1 (MQ=255)
                       cGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGtcttct            <  1:20259137/67‑1 (MQ=255)
                        gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg           <  1:26020009/67‑1 (MQ=255)
                        gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg           <  1:15727666/67‑1 (MQ=255)
                        gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg           <  1:21280801/67‑1 (MQ=255)
                        gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg           <  1:20228528/67‑1 (MQ=255)
                        gTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTg           <  1:20814430/67‑1 (MQ=255)
                          tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGtt        >  1:28800008/1‑68 (MQ=255)
                          tttttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGt         <  1:5338213/67‑1 (MQ=255)
                            tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa       >  1:21953950/1‑67 (MQ=255)
                            tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa       >  1:4035251/1‑67 (MQ=255)
                            tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa       >  1:24937863/1‑67 (MQ=255)
                            tttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTa       >  1:19467434/1‑67 (MQ=255)
                             ttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAc     <  1:4741028/68‑1 (MQ=255)
                             ttACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAc     <  1:12508385/68‑1 (MQ=255)
                              tACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAcc    <  1:7033504/68‑1 (MQ=255)
                              tACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAAcc    >  1:3108276/1‑68 (MQ=255)
                               aCTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCg   >  1:20385147/1‑68 (MQ=255)
                               aCTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCg   >  1:14217544/1‑68 (MQ=255)
                               aCTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCg   >  1:11376065/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCAGCATGTGACCTGGGTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:2125877/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTTTTCTGGTTAACCgg  <  1:6594007/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:712755/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:8607331/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:7114485/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:7462087/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:108388/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:13727955/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:6267745/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:10782324/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:8503594/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:15378016/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:16080110/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:16111475/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:17477598/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:4547576/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:4369927/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:18323581/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:19598920/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:21075760/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:27990480/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:21831055/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:273064/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  >  1:26308082/1‑68 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:10003244/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:2202147/68‑1 (MQ=255)
                                cTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCgg  <  1:24871880/68‑1 (MQ=255)
                                |                                                                   
CAGAAAACACGCTGGCACGCGGGCGTTTTTTACTCATTCACCATGTGACCTGGCTTGGCTTCAGCCTTGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGG  >  CP009273/2598047‑2598146

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑