| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 930,957 | C→G | 5.8% | P760A (CCG→GCG) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 930,957 | 0 | C | G | 5.8% | 869.9 / 6.2 | 286 | P760A (CCG→GCG) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/154); new base G (17/2); total (130/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
CCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930891‑931024 | ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACCACCAGTTcc > 1:1436747/1‑68 (MQ=255)ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTcc > 1:4865565/1‑68 (MQ=255)ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:25028137/1‑68 (MQ=255)ccTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCCCAACAACCAGTTcc > 1:20052013/1‑68 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:19325098/1‑67 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:9375457/1‑67 (MQ=255) cTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTcc > 1:28923465/1‑67 (MQ=255) tACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTccgcc > 1:4521309/1‑67 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTgcgccg > 1:27395903/1‑67 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTccgccg > 1:23018188/1‑67 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCcgccgc > 1:1075768/1‑68 (MQ=255) aCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCcgccgc > 1:27639517/1‑68 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgca > 1:13622259/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:22820956/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:21965285/1‑67 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca > 1:12169472/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcag > 1:23546147/1‑67 (MQ=14) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCCACAACCAGTTCCgccgcag > 1:904479/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACATCCAGTTCCgccgcag > 1:5935099/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTGCgccgcag > 1:12107681/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcac > 1:8509483/1‑66 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgcag > 1:29225545/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:14986637/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:3578697/1‑67 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcag > 1:17882423/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACACCCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGACGCCGCAACACCCCGTTGCgccgcagcc > 1:20292635/1‑67 (MQ=11) agcCGCAACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:13960100/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCAGTTCCgccgcagcc > 1:25746169/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTGCgccgcagcc > 1:18410300/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:28548446/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc > 1:5011094/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagcc < 1:11496349/67‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagc < 1:4238664/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgca < 1:348833/64‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccgca < 1:27204175/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:22185920/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:632172/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGccgcagccgcag < 1:2682709/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCGGTTGCACAGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCgccgcagccgca < 1:7781018/67‑1 (MQ=18) cGCAACAACCGGGTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCgccgcagccg < 1:20885148/65‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGt < 1:15738605/68‑1 (MQ=255) cacccGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCTCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATca > 1:13795335/4‑68 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagcag < 1:214356/68‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagca > 1:28147359/1‑67 (MQ=255) cGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATcagca > 1:4011377/1‑67 (MQ=255) ttGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGcc > 1:24088707/1‑67 (MQ=255) tGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCca < 1:12569480/67‑1 (MQ=255) tGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCca < 1:3029840/67‑1 (MQ=255) gCACCGCAGCAGCACTATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCcaca < 1:26222569/68‑1 (MQ=255) cACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCcaca > 1:10497999/1‑67 (MQ=255) cGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCactaca > 1:18513239/1‑67 (MQ=255) agcagcaATATCAGCAGCCGCAACACCCAGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATAAGCAGCCACAAAAGcc > 1:1750360/1‑67 (MQ=11) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCg < 1:25201378/65‑1 (MQ=255) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCg < 1:23851587/65‑1 (MQ=255) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCg < 1:11765153/65‑1 (MQ=255) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGt < 1:16555415/67‑1 (MQ=255) aaTATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgc > 1:7016831/1‑67 (MQ=255) atatCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgcgc < 1:11133257/68‑1 (MQ=255) atatCAGCAGCCGCAACAACCAGAGCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTgcgc < 1:6684789/68‑1 (MQ=255) atCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGcgccg < 1:28633930/68‑1 (MQ=255) tCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCCGCAGCCACACCCGCCGGTTGcgcccc > 1:17124869/1‑66 (MQ=17) cagcagCCGCAACACCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCAGGTTGCGCCGCa > 1:11388346/1‑68 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCa > 1:2775748/1‑68 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCa > 1:22460658/1‑68 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTAACAGCAGCCACAACAGCCGGTTGcgccgaa > 1:24351983/1‑66 (MQ=255) agcagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCa > 1:20462173/1‑67 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCacc > 1:1979372/1‑65 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc > 1:4939819/1‑68 (MQ=255) cagcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc > 1:21268380/1‑67 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGcc < 1:3924449/67‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:10019869/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:15552604/66‑1 (MQ=255) agcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGc < 1:13381115/66‑1 (MQ=255) gcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGccgc > 1:5208978/1‑66 (MQ=255) gcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcac > 1:22695594/1‑68 (MQ=255) ctcaacaaCCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:12934067/63‑1 (MQ=255) cGCAACAACCATTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCcaca < 1:3291566/67‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:17604520/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:7508967/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:1820253/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:18579325/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:20622281/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:25393893/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCca < 1:24387104/65‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:7159396/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:6769132/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:16834409/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:3756297/68‑1 (MQ=255) cGCAACAACCAGATCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACaa < 1:5729484/68‑1 (MQ=255) gCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAat < 1:876394/68‑1 (MQ=255) ccAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCACCCGCAAGATccgca > 1:14136548/1‑68 (MQ=17) ccAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCACCCACAATATcacca > 1:25324761/1‑68 (MQ=255) cggTTGCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCTCAATATcagca > 1:7983207/3‑67 (MQ=17) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCACTATcagca > 1:2702798/1‑67 (MQ=255) cAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAAGATcagca > 1:22874116/1‑67 (MQ=255) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATCCGCATTATCagcagcagc > 1:12392400/1‑68 (MQ=18) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCagcagc < 1:28797531/65‑1 (MQ=255) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCCGCAGCCGc > 1:28362867/1‑68 (MQ=255) tCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGc > 1:27891461/1‑68 (MQ=255) ccgccgCAGGCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGca < 1:12773855/68‑1 (MQ=255) | CCTGTACAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCA > CP009273/930891‑931024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |