New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 725679 | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/100 | NT | NA | coding (641/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
? | CP009273 | = 725702 | NA (NA) | coding (664/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
AGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725607‑725679 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 AGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTG > 1:1586317/1‑68 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:21008164/1‑68 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:7011780/1‑68 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:1396890/1‑68 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:25824470/1‑68 GCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGATGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG > 1:15799880/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGGCCCGGCGGGg > 1:10343321/1‑67 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:22828375/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:31753076/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:7131477/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:31332720/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:6629358/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:5138459/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:19715876/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:2181567/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:20140216/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:20347600/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:30160864/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:6757906/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:15403504/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:1127796/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:2676132/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:4708809/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:32883168/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:32680032/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:1478160/1‑68 CGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT > 1:32349043/1‑68 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:17679794/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:23341791/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:12468761/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:11951529/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:14325159/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:5000813/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:2023750/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:723880/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGT < 1:292831/67‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:25879266/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:33859158/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:424549/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:19751959/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:1788044/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGG < 1:33007213/66‑1 GGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGGACTGACCGGGCTGG < 1:25749603/66‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:19065466/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:10677500/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:25794934/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:15151450/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:15571726/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:23696450/67‑1 GTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGG < 1:19054664/67‑1 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:3219479/1‑67 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:13685763/1‑67 TGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA > 1:11851828/1‑67 CGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACG < 1:11542984/67‑1 TGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGC < 1:25599271/68‑1 TGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCG < 1:25983894/67‑1 TGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:29765774/68‑1 CGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:10491513/68‑1 gaACCGGGTACTGCCCGGGCTGGTGGAACGTCTGTTGGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:33521698/66‑1 ACCGGGCTGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCG > 1:16666750/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:32676523/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:33930530/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:33794443/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:11758164/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:11821887/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:11909979/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:28072866/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC < 1:16119403/68‑1 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:31872495/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:18625452/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:30716339/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGC > 1:29942715/1‑68 GGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:21214083/67‑1 GGTGGAACGCCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGG < 1:33571124/67‑1 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCTGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCATCGGCGCA > 1:15286180/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:24345285/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:2515165/1‑68 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGC < 1:29324/67‑1 GGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGGCAGTACCCGGTCCGGCGGCAGCGGCGCg > 1:24829907/1‑67 GGAACGCCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCA > 1:23002542/1‑68 GAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:21699648/1‑68 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTGAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:20882346/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:26207456/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:472705/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:17306119/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:11178701/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:8321995/1‑67 AACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG > 1:9318919/1‑67 AGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725607‑725679 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtggaACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAG < CP009273/725702‑725637 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |