| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725724 | NA (NA) | 20 (0.060) | 9/94 | NT | NA | coding (686/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725738 | NA (NA) | coding (700/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:5770591/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:4528826/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:20685276/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:34350592/1‑67 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:10157541/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:8302526/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:3630770/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:21286390/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:22909889/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGACTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:32699258/68‑1 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:1993969/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:33716757/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:26429543/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGCCGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:24606662/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:2847743/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:28177725/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:3979799/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:27754461/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:25977665/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:6548783/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:18306246/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:17361332/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:11973147/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:114588/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:15102105/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:14122407/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGGGGAACGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:23715026/67‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:12258738/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:31548734/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:22122010/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:16119708/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:11243028/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:4975897/1‑68 TGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCC < 1:18064009/68‑1 CCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGC < 1:5623655/67‑1 GGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGA < 1:7002364/68‑1 ACGTTCCACCGCGCAGCCGCCGGGGATTTCGCCGCGGAATTGACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACG > 1:1011995/1‑65 GTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGCACGTCTGT > 1:25710546/1‑68 GTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGT > 1:33115798/1‑68 CACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGC > 1:27388362/1‑68 CACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCGTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGC > 1:23064641/1‑68 ACCGCGCAGCCGCCGGTGCTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCGTCGCGGTGGGACGTCTGTGTGCG > 1:32484641/1‑68 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGCACGTCTGTGTGCGCCC > 1:2114522/1‑68 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCGGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC > 1:9742289/1‑68 AGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAA > 1:6368631/1‑67 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:2501947/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:3062445/1‑68 GCCGGTGCTTTCGCCGCTGAATGCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:11898147/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:5127231/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:8553914/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:33498772/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:10273299/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:29464624/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:1536502/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:29142205/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:28861948/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:12474192/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:12880334/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:3534080/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:7285847/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:18951295/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:13369925/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:485942/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:19104753/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:14714624/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:23889807/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:5574071/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:14214947/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:7640094/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:9036851/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:29370275/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:31923232/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:30225490/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:21679553/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:26831537/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCCGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:1096257/1‑67 CCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT > 1:31142628/1‑67 CCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT > 1:960025/1‑67 CCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT > 1:23459840/1‑67 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:4040860/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:1116809/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:4645247/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:26237438/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:23977134/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:27177023/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:30902985/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:21494267/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:16703188/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:17163194/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:17717037/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:7490917/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:1628351/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:17287052/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:10750746/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGCTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:14611029/68‑1 GTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA > 1:29659976/1‑67 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCCCCA > 1:34051881/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:15246882/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:19681699/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:13083669/1‑68 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |