| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1505831 = | 307 (0.740) | 15 (0.040) | 7/94 | NT | 5.5% | intergenic (+165/‑80) | ydcR/ydcS | putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative amino transferase/polyhydroxybutyrate (PHB) synthase, ABC transporter periplasmic binding protein homolog |
| ? | CP009273 | 1505880 = | 253 (0.730) | intergenic (+214/‑31) | ydcR/ydcS | putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative amino transferase/polyhydroxybutyrate (PHB) synthase, ABC transporter periplasmic binding protein homolog | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CTTACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1505905‑1505831‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acggcggctGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGCG > CP009273/1505880‑1505946 CTTACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGA < 1:19736078/67‑1CTTACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGA < 1:23803861/67‑1 TTACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACG < 1:34238855/68‑1 ACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGC < 1:24163426/68‑1 CTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:9568158/1‑68 CTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:28028782/1‑68 CTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG < 1:16879419/68‑1 CTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:30164873/1‑68 CTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:15992242/1‑68 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTTCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:22361958/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAATAATATCTCCTTGTTTAAGCATAGACGGCG > 1:12967935/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGGCGGCG > 1:4963140/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGG < 1:13525262/68‑1 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGG < 1:30964464/68‑1 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGG < 1:12300383/68‑1 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:29739021/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:10697603/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:22067105/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:22510197/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:9145786/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:24098152/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:8009705/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:25492997/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:27010168/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:27483772/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:27850591/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:7681032/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:7190952/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:30422141/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:7642613/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:31346897/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:33238298/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:33661931/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:33818287/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:34366566/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:6275623/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:14030172/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:17523893/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:17067968/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:18081883/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:11856847/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:12570294/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:15874206/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:13065038/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:15544188/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:15412424/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:14836752/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:14239586/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACAATAGACGGCG > 1:33548091/1‑67 TCCTGTCGTAATTAATTGTACAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCG > 1:21110574/1‑67 CTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCT > 1:1917823/1‑68 CTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCT < 1:7260802/68‑1 CGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCTGAAC < 1:23328921/68‑1 AATTGTTCCCCCGCCGTGCCGTAAAAAAATCCCCTTGTTTCACCATAGACGGCGGCTGAACAATTAAT < 1:25045852/68‑1 GTTCAGCCGCCGGGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGCCGGCTGAACAATTAATTACG < 1:1998607/68‑1 CGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATCGACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGA < 1:33881549/67‑1 CGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGCCGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGA < 1:9866661/67‑1 CGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGA < 1:3740121/67‑1 GCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGA < 1:7986570/67‑1 AAATATCTCCTTGTTAAACCATCGCCGGCGGATTAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGA < 1:2988012/68‑1 AAATATCTCCTTGTTAAACCATACACGGCGGCTTAAAAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGA < 1:20629817/68‑1 AAATATCCCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCTGAACAATAAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGA < 1:3881764/68‑1 TATCTCCTTGTTAAACCATAGACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCA < 1:6262469/68‑1 TCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGAC < 1:5990958/68‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTATGACCTTATGCGCAACAAATTTGCACGCAGCAGC < 1:33054249/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:21665491/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:19636116/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:33355599/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:19389225/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:32489664/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:21607777/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:14286222/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:16183919/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:28693372/67‑1 ACGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGC < 1:9324344/67‑1 CGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCT < 1:9619182/68‑1 CGGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCT < 1:23969881/68‑1 GGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTG < 1:1758056/68‑1 GGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTG < 1:33285820/68‑1 GGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTG < 1:16142564/68‑1 GGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTG < 1:17014329/68‑1 GGCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTG < 1:10197753/68‑1 GCGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGT > 1:31813641/1‑68 CGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGT < 1:19020366/67‑1 CGGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGT < 1:7863562/67‑1 GGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTG < 1:1207742/67‑1 GGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTG < 1:13932933/67‑1 GGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTG < 1:20244660/67‑1 GGCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTG < 1:16261485/67‑1 GGCTGAACAATAAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTG < 1:17091825/67‑1 GCTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGCCCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGT > 1:14560552/1‑67 tTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTG < 1:22274543/66‑1 CTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCCGCCTGTGTGC > 1:29220407/1‑68 CTGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTG < 1:15610344/67‑1 TGAACACTTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGCG < 1:23624113/68‑1 TGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGCG < 1:555598/68‑1 TGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGC < 1:28981485/67‑1 TGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGC > 1:28598528/1‑67 TGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGC < 1:27934069/67‑1 TGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGC < 1:1813708/67‑1 CTTACTCCTGTCGTAATTAATTGTTCAGCCGCCGTGCCGTAAAAATATCTCCTTGTTTAACCATAGACGGCGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1505905‑1505831‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acggcggctGAACAATTAATTACGACAGGAGTAAGACCTTATGAGCAAGACATTTGCCCGCAGCAGCCTGTGTGCG > CP009273/1505880‑1505946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |