New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2564003 = | 144 (0.350) | 9 (0.030) | 7/94 | NT | 5.7% | coding (1108/1404 nt) | eutE | aldehyde oxidoreductase, ethanolamine utilization protein |
? | CP009273 | 2564657 = | 177 (0.510) | coding (454/1404 nt) | eutE | aldehyde oxidoreductase, ethanolamine utilization protein |
ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2564078‑2564003 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgttgcccgCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAGC > CP009273/2564657‑2564723 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:18451801/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:15553203/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:6586787/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:12105/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:25883198/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:27342585/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:33632638/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:13958142/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:1398286/68‑1 ACGCGCCTGCTGTTTGTCGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:16710404/68‑1 ACGCGCCTGCGGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:33281035/68‑1 ACGCGACTGCTGTGTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGT < 1:10800126/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGc < 1:6731940/68‑2 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:28591431/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:33777393/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:4662314/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:19342060/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:6839371/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:1636620/68‑1 GCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGGGACTGAACTGATGATGCCGGTGT < 1:940816/68‑1 CGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTT > 1:23870386/1‑68 CGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTT > 1:2591802/1‑68 CGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTT > 1:12141273/1‑68 GCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG < 1:10122647/68‑1 GCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG < 1:31366077/68‑1 GCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG < 1:34141795/68‑1 GCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG < 1:34177626/68‑1 GCCTGCTGTTTGGGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG < 1:10969978/68‑1 CCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG > 1:19936157/1‑67 CCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTG > 1:5594414/1‑67 CTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCC < 1:15946306/68‑1 GCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCG > 1:7091546/1‑68 TTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCC < 1:18146717/62‑1 AGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGT > 1:16851184/1‑68 ACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGT > 1:20593138/1‑68 TCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAA > 1:14229736/1‑68 CTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGTGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCC > 1:15789630/1‑68 CTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGTGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCC > 1:15751059/1‑68 ACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGT > 1:22183839/1‑68 TGATGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTA > 1:28510322/1‑68 TGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTG > 1:14795112/1‑68 TGATGCCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTG > 1:21657160/1‑68 CCGGTGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAG > 1:23684151/1‑67 tggTGCCCGCGGCAATCACGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTC < 1:11642261/65‑1 TGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTC > 1:14445818/1‑68 TGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTC > 1:28253292/1‑68 TGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTC < 1:17804497/68‑1 TGTTGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTC < 1:13855328/68‑1 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACC > 1:23596639/1‑68 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACC > 1:4887801/1‑68 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCAC < 1:1590213/67‑1 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCAC < 1:16910345/67‑1 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCAC < 1:12463902/67‑1 TGCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCAC < 1:21033127/67‑1 GCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCG > 1:24936601/1‑68 GCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCG > 1:20493582/1‑68 GCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCG < 1:20231419/68‑1 GCCCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCG < 1:4198810/68‑1 CCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAA > 1:4883390/1‑68 CCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAA > 1:28680305/1‑68 CCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAA > 1:29171658/1‑68 CCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAA > 1:33134694/1‑68 CCGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGA < 1:4006988/67‑1 CGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAG < 1:33526562/68‑1 CGCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAG < 1:17439676/68‑1 CGCGGCAAGCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGCAGGCGTCACCGAAG < 1:31824279/68‑1 GCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAGC < 1:1969812/68‑1 GCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAG > 1:540644/1‑67 GCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAG > 1:1097689/1‑67 GCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAG > 1:13644688/1‑67 ACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2564078‑2564003 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgttgcccgCGGCAATCAGGCTGATGGCGTTGTTAATTACGGTTGCCGCCGGGTTAGTGGAAGGCGTCACCGAAGC > CP009273/2564657‑2564723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |