| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2691481 | 433 (1.040) | 25 (0.070) | 7/100 | NT | 5.9% | coding (429/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound |
| ? | CP009273 | = 2691501 | 410 (1.110) | coding (409/636 nt) | pgpC | phosphatidylglycerophosphatase C, membrane bound | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2691410‑2691481‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggctgCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGTT < CP009273/2691501‑2691435 TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:6791480/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:18147075/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:9312835/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:19083917/1‑68TGTGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:31274787/1‑68 GTGCGACCTATTCATGACCCAGTCAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGGCACCCTGAATTTGG < 1:33867039/68‑1 TGCGACCTTTTCATGTCCCATACAACTCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:8846054/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACCACGCATCGTCAATAACCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:7318530/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:22435324/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:32608510/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:31773352/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:31770396/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:25920292/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:7456760/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:30894244/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:1913312/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:9332125/1‑66 TGCGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTG > 1:29279507/1‑66 TGCGACATTTTAATGTCCAAGACAAAGCATCGTCAATAACCACCCACCATAGCCACGCTGAATTTGGg > 1:21045388/1‑67 CGACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:33529977/1‑68 gcCCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:3256147/3‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACACCGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:29300152/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:291750/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:680618/1‑67 GACCTTTTCATGTCCCAGACAACGCATCGTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTG > 1:32282437/1‑67 GTCAATACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAAT > 1:28749427/1‑68 ACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATGTTATCGCCAGCCAAATTCAGCG > 1:5100331/1‑68 ACCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGGTAATCTTATCGCCAGCCCAATTCAGCG > 1:27655486/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCCGGCAAATTCAGCGg > 1:30282110/1‑67 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGg > 1:3482353/1‑67 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:20526695/1‑68 CCCAACCACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGT > 1:27344970/1‑68 ACCATAGCCACGCTGAATTTGGGTGGCGCGGGTTAATATTATAGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCTTTG > 1:15112716/1‑68 ACCATAGCCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATG > 1:24496116/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:14173851/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:5245833/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTG > 1:33866911/1‑68 CCACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGGTG > 1:26479935/1‑68 ccCGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCATATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCTATGGTGGTTGG > 1:27546781/3‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:15240151/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGG > 1:1122549/1‑68 CACGCTGAATTTGGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGGGGCTATGGTGGTTGG > 1:14552197/1‑68 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:10891912/68‑1 GGCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGACAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATG < 1:15277007/68‑1 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:12546603/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:9584423/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:8172707/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:31105750/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:28492076/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:9660101/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:23705443/1‑68 GCTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC > 1:16573874/1‑68 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CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:11270583/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:12416687/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:13017950/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:1346373/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:14034910/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:14493229/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:15756988/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:16483551/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:18051545/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:19722929/1‑68 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCG > 1:19777746/1‑68 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CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:3600427/67‑1 CTGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGC < 1:21531117/67‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:10373991/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:27447918/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:8057542/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:10365267/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:12294088/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:24541571/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:6044583/1‑68 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT < 1:23491095/68‑1 TGCCGCGGGTTAATCTTATCGCCAGCCAAATTCAGCGTGGCTATGGTGGTTGGGTATTGACGATGCGT > 1:20301871/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |