| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 303 (0.730) | 22 (0.060) | 10/94 | NT | 8.8% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 204 (0.590) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 468 total aligned reads displayed.
TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTC > CP009273/4506675‑4506809 | ttCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCg < 1:3224113/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:10487093/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:6978583/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:29017045/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:26797080/68‑1 (MQ=255) gggtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcgg < 1:5266363‑M2/2‑1 (MQ=255) gggtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcgg < 1:18711427‑M2/2‑1 (MQ=255) gggtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcgg < 1:18203321‑M2/2‑1 (MQ=255) gggACCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTa < 1:26013978/65‑1 (MQ=255) gAACGTCCGGCTCAGGCGCAGCGCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:20693209/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:9748420/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:7400384/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:404391/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:23999800/67‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCCGCGCAGCACGCCGGTGGGGTTACGGGt < 1:20103150‑M1/44‑1 (MQ=255) accGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACggg < 1:15838327/65‑1 (MQ=255) aaCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGTGCTGCGCTGCG‑ATCCCGCCGTTGCGGTAACggg < 1:28770059/67‑1 (MQ=9) aaCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACggg < 1:12957249/67‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:3457970‑M2/8‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:13932063‑M2/8‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:19619841‑M2/8‑1 (MQ=255) cGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTa > 1:8434861/1‑68 (MQ=255) gTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTa > 1:29581293/1‑67 (MQ=255) tCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc > 1:11803914/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:8946657/1‑68 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:19203087/1‑68 (MQ=255) agccacgctaacccgttaccgcaacggcgggctgcgctgcgatccCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc > 1:373856‑M1/46‑68 (MQ=255) ccacgctaacccgttaccGCACCGGCGGGAT‑CGCAGCGCCGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGcgg < 1:20878483‑M1/50‑2 (MQ=255) ccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGt < 1:32327004‑M1/50‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:11571774/68‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:5617746/68‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:24544081/68‑1 (MQ=255) ccgctaacccgttaccgcaacggcgggctgcgctgcgatccCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg > 1:14833374‑M1/42‑68 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:1893013/1‑66 (MQ=255) acgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:33930764‑M2/18‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:30544570/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:33628503/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:25853606/1‑68 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt < 1:252095/68‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:10037632/67‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:12066339/67‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:5912245/67‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGAGTTAGCGTGGCTAtca > 1:31222539/1‑67 (MQ=255) cccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:8805587‑M1/58‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:6384815/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:2474271/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:33307408/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:30889931/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:222883/1‑66 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGGGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:6175549‑M1/58‑1 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCCGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:12901964‑M1/58‑1 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:25776317‑M1/58‑1 (MQ=255) ccgttaccgcaacggcgggatcgcagcgcagccCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:28243613‑M2/34‑66 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:18068225/1‑67 (MQ=255) ccGCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCAccc < 1:12238876‑M1/66‑1 (MQ=255) GCAACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCa < 1:4573205‑M1/67‑1 (MQ=255) AACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGc > 1:23397512‑M1/1‑67 (MQ=255) AACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCg < 1:1248110‑M1/68‑1 (MQ=255) ACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCgg < 1:32693982‑M1/68‑1 (MQ=255) ACGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTAGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCgg < 1:26504656‑M1/68‑1 (MQ=255) CGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt > 1:516006‑M1/1‑68 (MQ=255) CGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt > 1:16588253‑M1/1‑68 (MQ=255) CGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt > 1:31781035‑M1/1‑68 (MQ=255) CGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt > 1:16196308‑M1/1‑68 (MQ=255) CGGCGGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGt > 1:32083074‑M1/1‑68 (MQ=255) GGGAT‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTa < 1:25346929‑M1/67‑1 (MQ=255) t‑CGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCt < 1:4725273/68‑1 (MQ=255) agcgcagcACGCCGTTGTGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa > 1:21662851/1‑67 (MQ=255) agcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa < 1:3158059/67‑1 (MQ=255) agcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa > 1:2694207/1‑67 (MQ=255) agcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGaa < 1:15305398/67‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:7796730/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAg < 1:8042325/65‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:30050573/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:14980203/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGc < 1:18521497/66‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCt < 1:13405042/67‑1 (MQ=255) gcagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTc > 1:23853093/1‑68 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |