| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1870380 | 293 (0.710) | 16 (0.050) | 8/94 | NT | 5.3% | coding (451/1182 nt) | yeaN | putative transporter |
| ? | CP009273 | = 1870397 | 330 (0.950) | coding (468/1182 nt) | yeaN | putative transporter | |||||
Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 | aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:17436798‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:28426133‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:24618669‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgcc < 1:8062489‑M2/66‑6 (MQ=255) aCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAAGGGGAGCTGCAGCGGCCCTGGGATCGGCTATCGTCgtgccgc < 1:3846704‑M2/68‑8 (MQ=255) cTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgct > 1:29015816‑M2/1‑60 (MQ=255) tACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTgg < 1:24072547/68‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGc < 1:2908593/68‑1 (MQ=255) cGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCtt > 1:4117736/1‑68 (MQ=255) ggCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCttt > 1:7709552/1‑68 (MQ=255) gcgcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGAGGCACTGGGATCTGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTg > 1:18308641/1‑68 (MQ=255) gcATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCgtgccgctgcagctcc > 1:15463182‑M2/1‑51 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:16966189/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:25062847/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:11546881/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:14659174/68‑1 (MQ=255) atTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGt < 1:25727897/68‑1 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:15950353/1‑66 (MQ=255) tGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtg > 1:29826299/1‑66 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:27278518/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:488015/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:17282354/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:6256286/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:34401069/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:15143436/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:13535458/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:10990939/1‑68 (MQ=255) aCAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctg > 1:9030187/1‑68 (MQ=255) cAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctgg < 1:22063856/68‑1 (MQ=255) cAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctgg < 1:33947164/68‑1 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:27879018/1‑68 (MQ=255) aaTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTCCCGCTGGCTTTGAACGGTTTtggctggc > 1:30968112/1‑68 (MQ=255) aTGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGGTTTGAACGGGTTTGGCTGGCa > 1:5819530/1‑68 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:10632697/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAg > 1:13837238/1‑67 (MQ=255) ggAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGGTTTGGCTGGCAAg > 1:205912/1‑67 (MQ=255) gAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAgg < 1:31925433/67‑1 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGCCCGGTTGTGGCTGGCAAGgc > 1:24829231/1‑67 (MQ=255) aGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgc > 1:20170498/1‑67 (MQ=255) gCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc > 1:31598800/1‑68 (MQ=255) cTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGcgcg > 1:18484252/1‑68 (MQ=255) tGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGgcgc < 1:32734235/66‑1 (MQ=255) ggcAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCgtgccgctgcagctcccattgtcagggaatatgcgccgg > 1:30356573‑M2/2‑28 (MQ=255) ccAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCGTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGCCGCGtt > 1:12928805/2‑68 (MQ=255) aGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGtt > 1:4569186/1‑66 (MQ=255) aGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCGGGCAAGGCGCGTTg < 1:12378404/67‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:12778704/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:6974222/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:22408802/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:2163773/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:19794536/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:29261155/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:33409506/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:33117264/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:16449822/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa > 1:5289124/1‑68 (MQ=255) ggCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCa > 1:1580187/1‑68 (MQ=255) ggCACTGGGAGCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:11752581/65‑1 (MQ=255) ggCACTGGGAGCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCt < 1:26169257/66‑1 (MQ=255) ggCACTGGGAACGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTATTGGCTGGCAAGGCGCGTTGc < 1:32277598/65‑1 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt < 1:8597904/67‑1 (MQ=255) cACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:23023370/1‑67 (MQ=255) aCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:23582080/1‑66 (MQ=255) aCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCAt > 1:18644979/1‑66 (MQ=255) tGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTg > 1:27175010/1‑68 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa < 1:26576316/68‑1 (MQ=255) gggATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGa > 1:23321173/1‑68 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:31040183/67‑1 (MQ=255) tCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgt < 1:2097149/67‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:32543461/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:5686269/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:14840278/68‑1 (MQ=255) cGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATgtgt < 1:10208421/68‑1 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:9727402/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:1632665/1‑68 (MQ=255) gCTATGGTCGTGCCGCGGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:12241024/1‑68 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:17807881/67‑1 (MQ=255) tATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:20382255/67‑1 (MQ=255) tATGGTCGGGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGtttt < 1:25267087/67‑1 (MQ=255) aTGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc < 1:8461450/68‑1 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:28168061/1‑66 (MQ=255) ggTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctc < 1:30720906/68‑1 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:30556914/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:9336930/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:14386706/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:19018206/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:19504391/1‑65 (MQ=255) gTCGTGCCGCTCGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTcc > 1:21402778/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:18020584/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:3558948/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:23918458/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:24345456/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:14054040/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:27523369/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:29341051/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:11202747/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctct > 1:10289363/1‑67 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCctat > 1:13197261/1‑65 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTctg > 1:29517672/1‑68 (MQ=255) tCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATATGTTTTCctct > 1:16128410/1‑67 (MQ=255) | TCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGCTTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTG > CP009273/1870330‑1870463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |