| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3572747 | 633 (1.530) | 29 (0.090) | 8/92 | NT | 5.8% | coding (259/696 nt) | yhhW | quercetinase activity in vitro |
| ? | CP009273 | = 3572830 | 430 (1.260) | coding (176/696 nt) | yhhW | quercetinase activity in vitro | |||||
Only 100 of 685 total aligned reads displayed.
ATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAA > CP009273/3572763‑3572897 | aTTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCCACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATGTTTAt > 1:3759653/1‑68 (MQ=255)aTTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTAt < 1:23395626/68‑1 (MQ=255) tGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgc > 1:752848‑M2/1‑66 (MQ=255) gCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCATAATTTCCATATCTTTATgcg < 1:33367295‑M2/68‑4 (MQ=255) gCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcg < 1:27458264‑M2/68‑4 (MQ=255) gCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcg < 1:24599186‑M2/68‑4 (MQ=255) ccATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcggg < 1:8912036‑M2/68‑6 (MQ=255) ccATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcggg > 1:33740798‑M2/1‑63 (MQ=255) ccATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcggg < 1:14834093‑M2/68‑6 (MQ=255) ccATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcggg < 1:20871499‑M2/68‑6 (MQ=255) gCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgag < 1:17543239‑M2/68‑10 (MQ=255) gCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgag < 1:19913690‑M2/68‑10 (MQ=255) cTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:13602987‑M2/68‑11 (MQ=255) cTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:6505299‑M2/68‑11 (MQ=255) cTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:8646912‑M2/68‑11 (MQ=255) cTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:26605345‑M2/68‑11 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAACTTTCCATATCTTTATgcgggtgagt > 1:18663758‑M2/1‑57 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt > 1:32917552‑M2/1‑57 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:22971995‑M2/67‑11 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt > 1:3402551‑M2/1‑57 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt > 1:28528496‑M2/1‑57 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt < 1:16609386‑M2/67‑11 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagt > 1:4121911‑M2/1‑57 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTg < 1:173680/68‑1 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTg < 1:25968759/68‑1 (MQ=255) tGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTg < 1:7088934/68‑1 (MQ=255) gTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGc < 1:25278676/68‑1 (MQ=255) ccTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCg > 1:4496937/1‑68 (MQ=255) tGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagttccaga > 1:15262256‑M2/1‑52 (MQ=255) tGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagttccaga > 1:27724689‑M2/1‑52 (MQ=255) gATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGaa > 1:10002360/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:30601548/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc < 1:9543454/67‑1 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:31868075/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc < 1:28829276/67‑1 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc < 1:21497771/67‑1 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:6650787/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc < 1:5187705/67‑1 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:33512239/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:4798999/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:28041743/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:18301207/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc < 1:18117431/67‑1 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:17903434/1‑67 (MQ=255) tGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:16863049/1‑67 (MQ=255) tGCTAAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCAATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 1:29631049/1‑67 (MQ=255) gCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccc < 1:12052438/68‑1 (MQ=255) cAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgc < 1:22390559/68‑1 (MQ=255) cAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgc < 1:14396084/68‑1 (MQ=255) aaCAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATgcgggtgagttccagattatgagt > 1:18757105‑M2/1‑44 (MQ=255) aaCAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgc > 1:5776063/1‑67 (MQ=255) aCAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgc > 1:9223196/1‑66 (MQ=255) aCAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgc > 1:23837801/1‑66 (MQ=255) aGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgccctgccct > 1:25538461/1‑67 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGccctgccctg < 1:30729888/65‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:29904885/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:31563241/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:32683305/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:9844426/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:16134222/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCcctgccctgc < 1:24336841/66‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCt > 1:6201169/1‑67 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCt > 1:20648363/1‑67 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCt > 1:32447943/1‑67 (MQ=255) aCCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCt > 1:6853849/1‑67 (MQ=255) ttCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCaa > 1:20270781/1‑68 (MQ=255) ccAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAAt > 1:31416426/1‑67 (MQ=255) ccAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATc > 1:19606114/1‑68 (MQ=255) aCGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtc > 1:32233301/1‑68 (MQ=255) aCGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtc > 1:12303290/1‑68 (MQ=255) aCGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtc > 1:5379427/1‑68 (MQ=255) aCGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgt < 1:112180/67‑1 (MQ=255) gTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtcgt < 1:13248583/68‑1 (MQ=255) gTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtcgt < 1:13859066/68‑1 (MQ=255) gTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtcg > 1:29329293/1‑67 (MQ=255) aGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtcgtcg < 1:22722283/68‑1 (MQ=255) cAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTaa > 1:21736266/1‑68 (MQ=255) aaaaTTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAAt < 1:31133996/68‑1 (MQ=255) aaaaTTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAAt < 1:19287135/68‑1 (MQ=255) atatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAg < 1:10206833/68‑1 (MQ=255) atatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAg < 1:18945053/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:17035617/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:27275008/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:11635973/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:7855242/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:12804760/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:24985188/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:21075333/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:33067442/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:14135441/68‑1 (MQ=255) tatCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc < 1:34366097/68‑1 (MQ=255) atCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgc > 1:1559140/1‑67 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc > 1:21968403/1‑68 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc > 1:13033863/1‑68 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc > 1:30451840/1‑68 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc < 1:8147253/68‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc < 1:27013224/68‑1 (MQ=255) tCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAgcgc > 1:10587257/1‑68 (MQ=255) cTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGcgcg > 1:26416672/1‑68 (MQ=255) cTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGcgcg > 1:1095905/1‑68 (MQ=255) | ATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAA > CP009273/3572763‑3572897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |