| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 274 (0.660) | 37 (0.120) | 16/84 | NT | 15.5% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 197 (0.630) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 400 total aligned reads displayed.
AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACG > CP009273/3630132‑3630265 | aGGCACCGCCACGCCCGCCCGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:30729327/1‑68 (MQ=255)aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:29824729/1‑68 (MQ=255)aGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:8892371/1‑68 (MQ=255) ggCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAg < 1:33827961‑M2/68‑2 (MQ=255) ggCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACCGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAG > 1:29305473‑M1/1‑68 (MQ=255) cACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAga < 1:10419637‑M2/67‑3 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgc > 1:1556054‑M2/1‑61 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:2038931‑M1/68‑1 (MQ=255) gCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:33312425‑M1/68‑1 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcg > 1:34153493‑M2/1‑59 (MQ=255) cACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCG < 1:13721397‑M1/67‑1 (MQ=255) acccccgccagcACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:17702187‑M1/65‑1 (MQ=255) gcccgccAGCACCTGTAACTCTTCGCGCAACGGTTTTTGCAGAGTGAATGGCCCCCgccccgcgcggg < 1:33108699‑M2/68‑13 (MQ=255) gcccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggg < 1:5773491‑M2/68‑13 (MQ=255) cccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcggg < 1:7988654‑M2/67‑13 (MQ=255) cggccagCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgactggcgcgggtc < 1:16304634‑M2/66‑15 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtc < 1:17102386‑M2/68‑15 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggt > 1:30191707‑M2/1‑54 (MQ=255) ccgccAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggt > 1:32338838‑M2/1‑54 (MQ=255) cAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggt < 1:3944206‑M1/68‑5 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgcca > 1:18824525‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgcca > 1:23891211‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgc > 1:31970618‑M2/1‑46 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgc < 1:9752596‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgc < 1:12730730‑M1/66‑7 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:26697300/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:28176708/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:1582446/1‑68 (MQ=255) aCCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCAc > 1:31080312/1‑68 (MQ=255) tAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGATTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGa > 1:6752636/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcac > 1:22781403‑M2/1‑40 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:10610334/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:6487752/1‑68 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:22392595/1‑67 (MQ=255) aCTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAg > 1:16698392/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:5368094/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgca > 1:27115162/1‑56 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:32874931/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:4529150/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:25624906/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:25183668/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:10026608/1‑67 (MQ=255) ctctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAgg > 1:23453189/1‑67 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGcc > 1:14037137/1‑68 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGcc > 1:26419108/1‑68 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGcc > 1:27930814/1‑68 (MQ=255) tctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGGCtggtgccattcactctg < 1:21312540‑M1/68‑18 (MQ=255) ctTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgc > 1:9424025‑M2/1‑36 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataa < 1:19529031‑M2/67‑37 (MQ=255) aGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 1:18460266/1‑68 (MQ=255) aaCGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaacc > 1:9103313‑M2/1‑28 (MQ=255) tttATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCaa > 1:719313/1‑68 (MQ=255) tttATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCaa > 1:15201293/1‑68 (MQ=255) tATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc < 1:22961070/68‑1 (MQ=255) tATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc < 1:11358131/68‑1 (MQ=255) tATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc < 1:3770807/68‑1 (MQ=255) tATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc < 1:8301292/68‑1 (MQ=255) aTGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGGTCGGCAGCCCGTTGCGGCCAAATTGGTCGGCAATCt > 1:17905663/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:28674022/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:11622428/1‑68 (MQ=255) tGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGACAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCtt > 1:24879112/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaag < 1:18927108‑M2/68‑51 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACGCGCGCGGGTCtggggccatgcactctgcctaagccgttgctcgaag > 1:8692314‑M1/1‑32 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGCGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:4671948/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:28419507/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:11814243/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:6152178/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:21714538/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:23283962/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:3181320/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:30440134/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:20958162/1‑68 (MQ=255) gCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTta > 1:16047216/1‑68 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCgggtgccattcgcgctgcataaaccgttggtggaaga > 1:174753‑M1/1‑31 (MQ=255) cAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTtat > 1:5473407/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt < 1:7605879‑M2/67‑55 (MQ=255) gTGAATGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagag > 1:29534518‑M2/1‑13 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt > 1:18563139‑M1/1‑27 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt > 1:10524512‑M1/1‑27 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagtt > 1:4211967‑M1/1‑27 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:6995844/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:6384761/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:12951685/1‑68 (MQ=255) gTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc > 1:27394256/1‑68 (MQ=255) tGGCACCAgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggt > 1:484498‑M2/1‑8 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattccctctgcataaaccgttgctcgaagagtttcaggt > 1:2575103‑M1/1‑22 (MQ=255) tGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACg > 1:19771323/1‑68 (MQ=255) gCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGc > 1:33909042/1‑68 (MQ=255) 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ccAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGAc > 1:7947545/1‑68 (MQ=255) cAGACCCGCGCGGGTCtggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggtgctggc > 1:13419479‑M1/1‑16 (MQ=255) | AGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACCAAACGGCGACG > CP009273/3630132‑3630265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |