| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 64557 | 292 (0.760) | 16 (0.050) | 6/94 | NT | 5.5% | coding (1224/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 64577 | 305 (0.940) | coding (1204/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64483‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:9035036/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:2018341/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:31303650/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:12441072/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:9426746/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:11736764/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:20840378/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:13962179/1‑67 CAGAAAGGTGCTGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:17316457/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:22893458/68‑1 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:128573/1‑68 AAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:28625568/1‑68 tAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCTCTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:30799569/67‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATTGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:19214893/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:4696045/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:7030680/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:19469461/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:26152118/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG < 1:10968950/67‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:11400676/1‑67 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCT < 1:16473855/66‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCT < 1:26069722/66‑1 AGGTGCTGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:4168400/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:25288694/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:12275132/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:20051610/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:1855019/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:8843907/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:19370203/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:1357784/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:25344905/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:2625550/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:18471714/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACGGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:30171774/68‑1 GGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGCATCATAAAGCCCTGGCGGCGAGGTGAGGGGTTg > 1:12084292/1‑66 GCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:7228800/43‑1 GCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG < 1:23682648/36‑1 CTTTTATAGTCCAGCACCAGCCCTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCAGGGCGAGG > 1:31732823/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:5423318/1‑68 CACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGG > 1:20410423/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:4488638/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:18390292/1‑68 CTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTGTATGATTCAGTGCTGGTG > 1:30113476/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:29134825/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:22672008/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:5550539/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:24802008/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:13496485/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:10736508/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAc > 1:23539441/1‑67 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:387930/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:30666768/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:18040590/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:12951761/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:27966509/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:26146979/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:14286992/1‑68 CCTGTCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTTTGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:15243715/68‑1 CCTGGCGGGTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:31096732/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:23313506/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:18235023/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:294021/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:28497011/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:27069754/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:26953925/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:19982496/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:20224382/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:21212644/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:24200189/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:21587054/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:26913139/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:3682669/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:22444575/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:15534825/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:6567586/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:1747438/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:626285/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:28985391/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:14209867/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:11550752/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:14521542/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAAAAAA > 1:16321954/1‑67 CCTGGCGGATACGTTATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:16575799/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATTGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:18723562/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:5673045/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:26050085/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:3371842/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:29723251/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:2652924/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:20125710/68‑1 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:2481620/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:22113033/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:1901470/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:16401785/1‑64 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:3261779/1‑68 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:11853712/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |