| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 725724 | NA (NA) | 17 (0.050) | 12/94 | NT | NA | coding (686/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 725738 | NA (NA) | coding (700/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:11769153/68‑1CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:3391617/68‑1 GCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG < 1:9441124/68‑1 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:16773051/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:6664025/1‑67 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:3629831/1‑67 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:16728696/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC > 1:30040083/1‑68 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:18312904/68‑1 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:17271739/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:24639176/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:22199258/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:21098964/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:3163817/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:31204431/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:5165502/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:582141/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:28346868/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:8310044/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:9184391/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:28281571/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:22256888/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:22332648/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:20161378/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:304712/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:25553414/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:27007882/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:28759200/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:10223274/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:31436121/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:3806429/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:4658310/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:9817116/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:17926207/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:15997733/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:19625893/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:13099864/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:11214213/67‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGCCCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:22504046/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCGGCCGGTGA > 1:21980417/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:1008348/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:22709527/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:4069910/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:21712661/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:10774985/1‑68 TGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:2485973/49‑1 CGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGG < 1:18026380/68‑1 CGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGC > 1:7949444/1‑67 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC > 1:10485813/1‑68 GAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGA > 1:29943373/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:5329745/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:27999606/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:29709006/1‑68 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGACCGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:2886871/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:20702209/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:12317692/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:26380327/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:10649824/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:1505896/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:24114794/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:15122621/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:7107615/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:15892765/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:23802731/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:13789576/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:11437370/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:5909807/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:14849977/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:30701121/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:30170846/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:23952242/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:7396952/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:8880232/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGAGCGCCCGAAGCGGT < 1:19241393/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGGGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:2290672/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAAATCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:17108816/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:14395355/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:7759241/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:2154917/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:8109506/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:488795/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:25953003/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:26206500/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:17987494/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:31726995/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:2719331/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:15580782/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:12700462/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:2865017/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:16129875/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:24242280/67‑1 GGTGATTTCGCCGCTTAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:18514971/67‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:29256242/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:17001558/68‑1 TGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACC > 1:18895102/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:21415133/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:8682583/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:6168496/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA > 1:22436249/1‑68 GATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACC < 1:4398699/67‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |