| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3060669 = | 344 (0.890) | 14 (0.040) | 8/92 | NT | 5.6% | intergenic (‑137/+30) | ygfI/yggE | putative DNA‑binding transcriptional regulator/oxidative stress defense protein |
| ? | CP009273 | 3060693 = | 186 (0.590) | intergenic (‑161/+6) | ygfI/yggE | putative DNA‑binding transcriptional regulator/oxidative stress defense protein | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TTAGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3060746‑3060669‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtcgggctaCAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCACA > CP009273/3060693‑3060759 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:15868316/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:7759216/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG > 1:11627717/1‑68 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:4953366/68‑1 ACCTGTGGATCAACAAGCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:14762323/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:24754142/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:6310337/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:6433002/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:5868806/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:18488674/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:1114344/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:28315242/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGCCGTATTCGTCGG > 1:8806177/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:5020524/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:6105750/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:4218110/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:3731397/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:22197003/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:10121617/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:14172319/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:7877864/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:12868814/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:9195899/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:957575/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:10875010/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:9782931/1‑68 CTGTGGTTCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:26193183/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTCGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:23251682/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:25105349/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:2390937/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:25469817/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:27999671/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:22224648/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:10657736/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:29101697/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:19423727/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:1853746/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:8789692/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:8145099/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:16036852/68‑1 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:28626238/1‑67 CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:17635996/1‑67 CTGGGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:30049777/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:3148969/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:23352769/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:2622827/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:24579626/68‑1 GTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCT < 1:26754428/68‑1 GTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCT < 1:15092360/68‑1 TGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA > 1:4451038/1‑68 TGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA > 1:10249323/1‑68 TGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA > 1:14658338/1‑68 CGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGT < 1:18419428/68‑1 TAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCT < 1:2375205/68‑1 TAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCT < 1:6487725/68‑1 TAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCT < 1:6008295/68‑1 TAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCT < 1:4367298/68‑1 TAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCT < 1:23200495/68‑1 AAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGC < 1:720998/68‑1 ACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC > 1:25158311/1‑44 CCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTG < 1:22560531/68‑1 CCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTG < 1:26577594/68‑1 GCAGCACAATAATATTTGTCGCCCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTT < 1:28560198/68‑1 AATAATATTTGTAGCCCGCCGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGG < 1:11759306/68‑1 CCGACGTATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGG < 1:30470893/68‑1 ATTCGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTACAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAA < 1:1592451/67‑1 CGTCGGGCTACAAATGTTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGG > 1:21371517/1‑68 CGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGG < 1:12531165/68‑1 CGTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGG < 1:4649975/68‑1 GTCGGGCTACATATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA > 1:14101000/1‑68 GTCGGGCTACAGATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA > 1:14137670/1‑68 GTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA > 1:32095547/1‑68 GTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA > 1:9926684/1‑68 GTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA < 1:16542227/68‑1 GTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA > 1:832184/1‑68 GTCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGA < 1:13165764/68‑1 TCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAA > 1:19187132/1‑68 TCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAA > 1:7151268/1‑68 TCGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAA > 1:25668374/1‑68 CGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAG < 1:31744535/68‑1 CGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAG < 1:20097936/68‑1 CGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAG < 1:18009345/68‑1 CGGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAG < 1:10696139/68‑1 GGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGA < 1:19228623/68‑1 GGGCTACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGA < 1:19899612/68‑1 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TACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCAC < 1:27641702/68‑1 TACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGGTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCAC < 1:7329851/68‑1 ACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCACA < 1:1309842/68‑1 ACAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCACA < 1:26429391/68‑1 TTAGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3060746‑3060669‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtcgggctaCAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCACA > CP009273/3060693‑3060759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |