| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613129 | NA (NA) | 13 (0.040) | 7/106 | NT | NA | coding (578/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613200 | NA (NA) | coding (649/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613060‑3613129‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGC < CP009273/3613200‑3613134 gGCATCGTTATCTGGCGTCAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGGTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:8953070/67‑1CGCATGGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:27421270/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:6114245/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:7305178/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:3586624/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:26903172/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:19228318/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:11952019/68‑1CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:1923652/68‑1CGCAGCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:15689024/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:19398714/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:1119177/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:3503137/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG > 1:30158949/1‑67 GCAGCGTTATCTGGCGACAACCAGTCCGCCGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:8260106/67‑1 ATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCag > 1:5609870/1‑66 ATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC < 1:4127279/67‑1 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:25156056/63‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAA < 1:10462030/68‑1 CTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGACGTGGTGGCTGCTCCGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGa > 1:12281042/1‑67 TGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG‑CCGAAGCGGTCC < 1:18583954/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCC < 1:20296704/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCC < 1:3026952/68‑1 CGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCA < 1:17500274/67‑1 CAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:17985960/68‑1 CAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGTGGGTGGGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAG < 1:17949119/68‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:18448945/66‑1 cCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:10218836/67‑1 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:13545405/68‑1 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:17742376/68‑1 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:1916286/68‑1 CGTGGTGGCTGCTCGGTTGGGGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTA < 1:3826400/68‑1 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCCGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:3151084/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCCGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:11709961/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCCGGCAGCACCTCATCC > 1:25850559/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCCGGCAGCACCTCATCC > 1:8279440/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCTCCTCATCC > 1:28579847/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCGCCTCATCC > 1:11329854/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCC > 1:21171939/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCC > 1:16726603/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCC > 1:23368519/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCC > 1:503066/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:8165253/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:9604299/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:29198853/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:29506309/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:9326469/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:29751879/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:891961/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:30057661/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:30093094/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:30093105/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:8275759/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:7476222/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:30997185/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:7415567/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:7282410/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:5301811/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:5175613/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:4339141/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:4854217/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:19815082/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:10275533/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:1061848/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:11152771/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:12198920/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:12304620/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:12574541/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:14769002/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:15106667/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:15268243/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:15644647/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:16962260/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:18888407/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:27633203/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:20311299/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:26159413/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:27588489/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:27288569/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:26691453/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:26438396/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:26347990/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:20663860/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:25723475/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:24771026/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:24724231/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:23388993/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:21530036/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:21458207/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:21141130/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:21017685/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCCGCAGCGGCGCAGGCAGCACCACATCC > 1:11329840/1‑67 CCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCAGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCC > 1:8978873/1‑67 CCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCCGCACCTCATCC > 1:1194371/1‑66 CCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGC < 1:12703939/68‑1 CCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGC < 1:8210016/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613060‑3613129‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGC < CP009273/3613200‑3613134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |