| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613137 | NA (NA) | 6 (0.020) | 5/98 | NT | NA | coding (586/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613192 | NA (NA) | coding (641/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613064‑3613137‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcggTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC < CP009273/3613192‑3613127 TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:12309506/1‑68TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:4698267/1‑68 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA > 1:22779910/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGTTGCCGGAA > 1:1602207/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:15472915/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:26592876/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:21484156/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:22901770/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:31052871/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:3975956/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:13692668/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:15865841/68‑1 TATCTGGCGACCAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:23084482/67‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC > 1:19061108/1‑68 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:14039748/67‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:14076669/67‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCGCGGTTCGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:14273497/67‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:30755515/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:3706829/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:17458202/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:21331303/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:2038688/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:31730569/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:21295660/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:15472844/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:15183392/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:23228364/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:23499099/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:24357048/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:29150864/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:7884501/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:13550958/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:8150288/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:8411859/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:29113862/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:11922535/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:28628900/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:27229184/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGAGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:22821744/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCC < 1:10253745/68‑1 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AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:10463138/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:28276605/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:9135697/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:6493514/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:29896151/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:30223530/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:5725295/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:5320507/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:4887885/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:461183/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:4031803/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |