| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 149 (0.390) | 20 (0.060) | 5/96 | NT | 11.1% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 192 (0.580) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 | ggCTGGGGCGATTTTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGACGAATGGGCTcg < 1:10980159‑M2/68‑3 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:589367‑M2/68‑3 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:5417752‑M2/68‑3 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:7816092‑M2/68‑3 (MQ=255)ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGAATGGACTACGCCGCCGGAGTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg > 1:11858622‑M2/1‑66 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAGTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:27232589‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:27605603‑M2/68‑5 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:30404174‑M2/68‑5 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:23837325‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:9237670‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:4344103‑M2/1‑62 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:2816232‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:6385047‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:2339659‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:8176602‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGCCTTTATCTTTATCCGTCGCCTGGGCTcggcggc > 1:23238512‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:1149824‑M2/66‑8 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGCCTGGGCTcggcggcgtagt > 1:23763623‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:2028310‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:3439399‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:16769957‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcagcggcgtagt > 1:26995522‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:26221086/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGAc < 1:19656728/68‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:25913239‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTAAGCACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:19724937‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:31556623‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:27104166‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg < 1:15612661/68‑1 (MQ=255) tgtgCAAGCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:22695081‑M2/1‑54 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:25282151/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:15176434/67‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc > 1:22949393/1‑68 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc < 1:6892768/68‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc > 1:14733118/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:30010459/1‑68 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:24838447/68‑1 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:611369/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:14269718/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:7325506/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:15455588/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:12168850‑M2/1‑41 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:31646335/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:29059713/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:28267946/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:7695547/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:13156449/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:16668057/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:29239200/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCAGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:11587829/1‑67 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:31188930/1‑66 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:24733293/1‑66 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:18599256/1‑66 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:13082360/68‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTATATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:21166529/68‑1 (MQ=255) gcgccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgcacaatcg < 1:10169496‑M2/66‑32 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGCCCCGTGCTCa > 1:16359612/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:20440839/1‑67 (MQ=255) gccgccGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCa > 1:17796807/1‑67 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:28655080/1‑68 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:23636387/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:3768526/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:5737287/67‑1 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc < 1:16227792/67‑1 (MQ=255) gccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGt < 1:17986550/68‑1 (MQ=255) aTTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTg > 1:1068013/1‑67 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGcc < 1:12846396/68‑1 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGcc < 1:22269873/68‑1 (MQ=255) tttATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGcc < 1:31720441/68‑1 (MQ=255) tATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACTGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTATTGCCGt < 1:7094492/68‑1 (MQ=255) tttCTGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:26924293/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:9656484/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:27972603/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:946253/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:15882061/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:17068450/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:4789011/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:19337302/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:20227323/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:20688212/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:29685712/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:297887/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:24067744/68‑1 (MQ=255) tttATGCGTCGACTGGGCGCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:21756360/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGTGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTggg < 1:18852536/67‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:12629814/68‑1 (MQ=255) ttATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGt < 1:6654548/68‑1 (MQ=255) tATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTa < 1:14587773/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt > 1:17477187/1‑68 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAtt < 1:20984460/68‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAt > 1:30637247/1‑67 (MQ=255) tGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTAt > 1:31872020/1‑67 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:19233868/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc < 1:24001343/68‑1 (MQ=255) gCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTc > 1:13797586/1‑68 (MQ=255) gTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTcac < 1:13375851/68‑1 (MQ=255) gACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACAtt > 1:3982738/1‑68 (MQ=255) aCTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACAtt > 1:16972011/1‑67 (MQ=255) aCTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACAtt > 1:18436247/1‑67 (MQ=255) gCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTgcggc > 1:26531529/1‑67 (MQ=255) | GGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTTTGCCGTTGGGTATTCACATTGCGGCGCA > CP009273/610388‑610520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |